16个高丛越橘品种VcCBF基因的单核苷酸多态性(SNP)分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王甲威

作者： 王甲威;林科;姜超;魏海蓉;刘庆忠

作者机构：

关键词： CBF;单核苷酸多态性(SNP);越橘

期刊名称： 东北农业大学学报

ISSN： 1005-9369

年卷期： 2012 年 43 卷 10 期

页码： 41-44

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： CBF是与植物抗寒、抗旱等抗逆性相关的一种转录因子,在植物抵抗逆境过程中发挥重要作用。以16个高丛越橘品种为试材,采用直接测序法克隆VcCBF基因,共克隆到94个非重复序列,对这些序列进行单核苷酸多态性分析,测序总长度63 732 bp,共发现103个SNP,单核苷酸多态性发生频率为1/619 bp,核苷酸多态性值(Pi)为0.01274。在103个SNP中,单态突变位点为52个,简约信息位点为51个,其中双突变为50个,三态突变为1个。通过碱基转换方式的分析发现,转换共83个,颠换19个,转换与颠换的发生比率为4.37 1。通过单倍型分析发现在16个越橘品种中VcCBF基因存在5种单倍型。

分类号： S663.9

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