副猪嗜血杆菌神经氨酸酶的克隆测序与生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 车勇良

作者： 车勇良;陈如敬;王隆柏;江斌;吴学敏;刘玉涛;庄向生;周伦江

作者机构：

关键词： 副猪嗜血杆菌;神经氨酸酶;二级结构;B细胞抗原表位;预测

期刊名称： 中国兽医学报

ISSN： 1005-4545

年卷期： 2013 年 33 卷 09 期

页码： 1339-1344

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 对副猪嗜血杆菌神经氨酸酶基因进行PCR扩增、克隆和测序,并进行同源性比较。应用生物信息学方法,对副猪嗜血杆菌神经氨酸酶的二级结构和B细胞抗原表位进行预测。结果显示,副猪嗜血杆菌神经氨酸酶基因全长2 007bp,编码668个氨基酸,同源性分析显示所测5株不同血清型的副猪嗜血杆菌神经氨酸酶基因相似度在98%以上,对应氨基酸相似度在97%以上。二级结构的预测结果显示该酶主要以无规则卷曲、α螺旋和延伸链为主,只有少数的β转角;推测该酶有16个B细胞优势抗原表位区域、8个糖基化位点。该研究为进一步分析副猪嗜血杆菌免疫机理、表位疫苗设计等奠定理论基础。

分类号： S852.612

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