基于高通量测序分析中华辣椒果实发育期相关的miRNA

文献类型： 中文期刊

第一作者： 郭河瑶

作者： 郭河瑶;张国儒;袁雷;唐亚萍;杨涛;石林媛;杨生保

作者机构：

关键词： 中华辣椒;果实成熟;microRNA

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2024 年 22 卷 011 期

页码： 3495-3503

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 辣椒的成熟过程是一个受基因调控表达以及多种通路协作完成的复杂的过程,其中microRNA在调控基因表达方面具有重要的作用.本研究为了进一步探索辣椒果实中miRNA及其靶基因在果实成熟过程中的功能,构建了中华辣椒(Capsicum chinense)绿熟期、转色期、红熟期不同成熟时期果实的小RNA文库,并利用生物信息学分析探讨其调控过程中的信号通路.结果表明,三个时期分别获得22 138 507、17 692 000和14480 729条miRNA序列,共鉴定出149条保守的miRNA.其中,绿熟期到转色期下调表达和上调表达的miRNA分别有3和7条,绿熟期到红熟期下调表达和上调表达的miRNA分别有26和22条,说明microRNA参与了果实成熟的过程.靶基因预测及功能富集分析显示它们可能参与了乙烯、生长素、细胞分裂素、脱落酸、茉莉酸介导的信号途径.本研究结果为今后辣椒成熟中的激素调节变化的研究提供了可能的理论依据.

分类号： S641.3

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