基于SLAF-seq技术的葡萄种质遗传多样性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李贝贝

作者： 李贝贝;张恒;姜建福;张颖;樊秀彩;房经贵;刘崇怀

作者机构：

关键词： 葡萄;SLAF-seq;SNP;遗传多样性

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2019 年 46 卷 11 期

页码： 2109-2118

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用简化基因组测序技术(SLAF-seq)对304份葡萄种质进行测序,最终获得466 618个SLAF标签,其中多态性SLAF标签392 374个。通过序列分析,获得481 192个有效单核苷酸(SNP)多态标记,并基于这些SNP分析和构建了304个葡萄种质的群体结构和系统发生树。结果表明,SLAF-seq技术能高效、低廉地开发出大量可用于群体遗传分析的SNP标记。通过构建进化树分析发现,欧亚种、欧美杂种及野生种葡萄彼此分开,其中姊妹系品种及具有亲子代关系的品种各自聚在一起,中国葡萄地方品种与国外古老葡萄品种的亲缘关系最近,且起源及遗传背景不详的古老葡萄品种与野生种的亲缘关系较改良品种更近。该结果可为后期进一步研究葡萄的起源进化提供参考,同时为构建SNP指纹数据库提供了基础数据。

分类号： S663.1

  • 相关文献

[1]苹果属植物种质多样性的SLAF-seq分析. 高源,王大江,王昆,丛佩华,李连文,朴继成. 2020

[2]基于SLAF-seq技术的向日葵SNP标记开发与利用. 马宇,于海峰,侯建华,石煜,温蕊,李振. 2018

[3]基于SLAF-seq技术的山西省地方梨品种的SNP分析. 白牡丹,郝国伟,张晓伟,杨盛,郭黄萍. 2020

[4]利用简化基因组技术分析甘薯种间单核苷酸多态性. 石璇,王茹媛,唐君,李宗芸,罗永海. 2016

[5]基于SLAF-seq技术分析甜、糯玉米种质遗传多样性. 李余良,索海翠,韩福光,刘建华,胡建广,高磊,李武. 2019

[6]紫花羊耳蒜SNP标记开发及居群遗传多样性分析. 崔学强,邓杰玲,黄昌艳,张自斌. 2023

[7]利用SALF-seq简化基因组测序分析茄子种质资源遗传多样性. 冯恩友,肖熙鸥,林文秋,莫定鸣,冯晓赓,马飞骏. 2022

[8]2016年北京地区玉蜀黍黑粉菌遗传多样性分析. 李超,金海伦,高利,刘太国,刘博,陈万权. 2018

[9]我国家养雉鸡MHC B-F基因外显子2 SNP检测与分析. 李启军,宁浩然,宋超,袁红艳,夏述忠,吴琼. 2019

[10]基于SNP标记揭示我国小麦品种(系)的遗传多样性. 刘易科,朱展望,陈泠,邹娟,佟汉文,朱光,何伟杰,张宇庆,高春保. 2020

[11]基于SNP和SSR分子标记的番茄种质资源遗传多样性分析. 王涛,扈艳萍,朱华,张子君,邹庆道. 2020

[12]基于限制位点相关的DNA(RAD)测序技术检测甜菜多态性. 刘蕊,董宇飞,刘乃新,吴玉梅. 2020

[13]河南省近年审定小麦品种基于系谱和SNP标记的遗传多样性分析. 曹廷杰,谢菁忠,吴秋红,陈永兴,王振忠,赵虹,王西成,詹克慧,徐如强,王际睿,罗明成,刘志勇. 2015

[14]大口黑鲈EST-SNP标记开发及其与生长性状的相关性分析. 李胜杰,白俊杰,赵荦,朱冰,朱新平. 2018

[15]TLR4基因SNP检测及在中外鸡种中的群体变异分析. 宋咏梅,庞建建,赵桂苹,刘冉冉,李鹏,赵兴旺,郑麦青,文杰. 2010

[16]基于2b-RAD技术分析白化茶树品种(系)遗传多样性. 刘声传,许应芬,魏杰,鄢东海,陈智雄,徐霖,刘燕,周玉锋. 2022

[17]单核苷酸多态性在植物研究中的应用. 张传福,景蕊莲,张改生,高宁. 2004

[18]基于全基因组重测序SNP标记的148份马铃薯种质遗传多样性分析. 韩志刚,郝文胜,谢锐,郭景山,伊六喜,侯建华. 2021

[19]基于SNP和InDel标记的余甘子群体遗传分析. 普天磊,金杰,何璐,瞿文林,廖承飞,袁建民,罗会英,赵琼玲. 2023

[20]中国野生种葡萄mybA转录因子SNP特征分析. 焦健,刘崇怀,樊秀彩,张颖,孙海生,姜建福,李民. 2013

作者其他论文 更多>>

微信小程序