利用两种统计模型对中国肉用西门塔尔牛屠宰性状的全基因组关联分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 常天鹏

作者： 常天鹏;夏江威;宝金山;金生云;朱波;徐凌洋;陈燕;张路培;高雪;李俊雅;高会江

作者机构：

关键词： 线性混合模型;复合区间定位;GWAS;胴体重;骨重;中国肉用西门塔尔牛

期刊名称： 畜牧兽医学报

ISSN： 0366-6964

年卷期： 2018 年 04 期

页码： 833-840

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 旨在利用两种统计模型对中国肉用西门塔尔牛的胴体重和骨重两个屠宰性状进行全基因组关联分析(GWAS),并比较不同模型的分析结果,促进GWAS的方法研究。本研究以1 301头中国肉用西门塔尔牛为试验材料,通过实地采集和测量获得样品和表型数据,通过提取样品DNA,并利用Illumina BovineHD(770K)芯片分型获得基因型数据,采用线性混合模型(LMM)和复合区间定位-线性混合模型(CIM-LMM)两种模型进行关联分析,定位影响目标性状的显著SNPs及候选基因;同时对两种模型的GWAS结果进行对比,探讨模型的优劣。结果表明,CIM-LMM检测到了LMM检测的所有显著SNPs(P<0.05),显示出更高的统计效力。本研究共识别8和7个SNPs分别与胴体重、骨重显著关联,其中有2个SNPs与这两个性状都相关。这些SNPs主要分布于3、5、6、10、14、16、17号染色体上,其中6号和14号染色体显著SNPs分布较为集中;最终找到了11个候选基因,同时探讨了GCNT4、ALDH1A2、LCORL和WDFY3等基因的功能。本研究为中国肉用西门塔尔牛屠宰性状的遗传机理做了探索,并且为GWAS研究方法开拓了新的思路。

分类号： S823.2

  • 相关文献

[1]舍饲养殖对阿什旦牦牛生长性能及屠宰性能的影响. 李生福,马进寿,梁春年,陈清文,刘更寿,殷满财,赵寿保,文志平,李永平,杜元梅. 2020

[2]动物遗传设计群体混合模型连锁分析方法. 杜杰,李红旺,高会晓,崔妍,杨润清. 2015

[3]动物全基因组关联分析的混合模型方法. 韩丹丹,赵敬丽,王丽娟,杨润清. 2017

[4]应用混合线性模型鉴定双单倍体玉米测交组合. 段民孝,范弘伟,赵久然,王元东,邢锦丰,杨国航,张华生,王继东,张雪原. 2010

[5]中国肉用西门塔尔牛育种目标性状的选择及其经济权重的测算. 薛景龙,朱波,张文刚,夏江威,高会江,李俊雅,张国梁. 2016

[6]中国肉用西门塔尔牛场间遗传联系分析. 周姵诺,蔡文涛,陈燕,张路培,徐凌洋,高雪,高会江,王泽昭,朱波,李俊雅. 2021

[7]我国肉用西门塔尔牛群体生长发育性状遗传参数估计及其遗传进展. 朱波,李姣,汪聪勇,徐凌洋,陈燕,高雪,张路培,高会江,李俊雅. 2020

[8]不同杂交组合与世代5月龄羔羊产肉性能测定分析. 侯广田,郝耿,杨会国,薛正芬,冯克明,卡纳提,古丽萨拉,艾比西,哈迪夏. 2008

[9]提高肉牛胴体重的措施. 赵景娣. 2013

[10]无角牦牛产肉性能研究. 梁春年,吴晓云,王宏博,张国模,拉环,包鹏甲,冯宇诚,王伟,阎萍. 2017

[11]罗马尼亚畜牧业发展状况. 张振兴,孔琳,刘现武. 2011

[12]卵巢摘除对育肥藏北绵羊体重和屠宰率的影响. 宋天增,陈晓英,马金英,徐亚欧,张四中. 2016

[13]卵巢摘除对育肥藏北山羊GH水平和生产性能的影响. 宋天增,冯静,陈晓英,马金英,徐亚欧,张四中. 2017

[14]广灵大尾羊产肉性能的研究. 罗惠娣,毛杨毅,周胜花,郭慧慧,李希,李春艳,张丽,薛丽娜,吴苏君,赵鹏,李俊,王志武,张冠武,郭宏宇,田晖. 2014

[15]莱芜猪胴体重、背膘厚和肌内脂肪含量的相关分析. 任一帆,高世超,赵雪艳,王彦平,李菁璇,张传生,王继英. 2021

[16]北美猪的育种体系. 王立贤,程笃学. 2005

[17]牦牛肉生产关键技术的研究. 王敏强,陆仲璘,阎萍,柏家林,杨博辉,韩凯,李吉林,赵龙泉. 2005

[18]甘南草原高原鼢鼠年龄划分及其组成分析. 苏军虎,彭然,南志标,JIWei-Hong,蔡卓山. 2018

[19]无角牦牛的产肉性能及肉品质分析. 梁春年,王宏博,吴晓云,张国模,褚敏,殷满财,郭宪,包鹏甲,丁学智,马金寿,武甫德,阎萍. 2018

[20]新技术新方法在羊饲料与营养中的应用. 刁其玉,屠焰,张乃锋. 2004

作者其他论文 更多>>

微信小程序