利用基因芯片分析比较Giza75和SG747纤维发育差异表达基因

文献类型： 中文期刊

第一作者： 宋吉坤

作者： 宋吉坤;辛玥;李龙云;刘国元;裴文锋;马建江;曲延英;于霁雯;吴嫚

作者机构：

关键词： 海岛棉;陆地棉;棉纤维品质;基因芯片;差异表达基因

期刊名称： 新疆农业科学

ISSN： 1001-4330

年卷期： 2022 年 59 卷 006 期

页码： 1312-1320

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]利用适应性广、产量高的陆地棉和纤维品质优异的海岛棉进行高通量基因芯片比较分析,筛选和鉴定棉纤维发育相关的关键基因.[方法]以SG747(Gossypium hirsutum L.)和Giza75(Gossypium barba-dense L.)为材料,利用Affymetrix公司的棉花寡聚核苷酸基因芯片对其开花后10 d(10 days after anthesis,10 DPA)的棉纤维进行表达谱分析.[结果]材料Giza75和SG747共筛选到3905个差异表达基因,其中功能预测基因占比17.80%,翻译、核糖体结构相关基因占比16.82%,翻译后修饰占比14.32%.Gra.2198.1.A1 at正向调控棉纤维发育过程,Gra.85.1.S1 at、Ghi.249.1.A1 at和Ghi.8448.1.S1 x at负向调控棉纤维发育过程,可能参与了棉纤维发育过程.[结论]利用陆地棉和海岛棉基因芯片并结合qRT-PCR筛选和鉴定到4个纤维发育相关的关键候选基因.

分类号： S562

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