虫害胁迫棉花基因表达谱的生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 武娟

作者： 田文华;齐放军;张永军;吴孔明;郭予元

作者机构：

关键词： 棉花;虫害胁迫;基因芯片;生物学功能;虫害防御基因

期刊名称： 植保科技创新与病虫防控专业化——中国植物保护学会2011年学术年会论文集

ISSN：

年卷期： 2011 年

页码： 1

收录情况： CSCD

摘要： 植物被昆虫取食后可诱导一系列生理生化代谢通路发生变化,启动直接防御或间接防御等防御机制,发掘棉花受棉铃虫为害后相关防御基因,对于解析昆虫取食诱导植物的防御反应机制具有重要意义。本研究用棉铃虫幼虫分别取食胁迫棉花(中棉所12)6h、12h、24h和48h,采用Affymetrix棉花基因芯片分析正常生长的棉花与受虫害胁迫不同时间的棉花差异基因表达谱。运用生物信息学技术对棉花芯片时间序列差异表达基因分析发现,虫害胁迫24h和48h时,基因表达水平基本持平,主要差异体现在取食6h、12h、24h3个时间点之间;对时间序列差异基因进行K-means聚类分析可将差异基因分为4类。对差异基因进行生物学功...

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