鲤鱼基因组同源框Hoxa3a序列同源性分析与分子进化研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 耿波

作者： 耿波;关云涛;孙效文;匡友谊

作者机构：

关键词： 鲤;同源框基因;序列同源性;分子进化;SNP

期刊名称： 水产学杂志

ISSN： 1005-3832

年卷期： 2011 年 24 卷 04 期

页码： 52-55

摘要： 本文利用生物信息学软件分析了鲤(Cyprinus carpio)基因组中同源框基因Hoxa3a与多种鱼类及其它生物的同源性,构建了分子进化树。结果表明:鲤与斑马鱼(Danio rerio)的序列同源性最高为95%,与大西洋鲑(Salmo salar)等四种鱼类的同源性次之为84%,与米氏叶吻银鲛(Callorhinchus milii)和鳐(Leucoraja erinacea)的同源性最低为74.5%,与三种鸟类的同源性为75%左右。这结果也说明,Hox同源框基因序列在进化上高度保守。在序列比较的同时发现了2个鲤的SNP位点,T101C和A213G。上述研究结果,对于保护生物多样性(尤其是遗传多样性)的研究,揭示生物进化历程及机理具有十分重要的意义。

分类号： S917.4

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