绵羊VPS26A基因克隆、生物信息学及表达谱分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张双双

作者： 张双双;王丹;贾琪;陈小辛;刘艺;戢爽;张立春

作者机构：

关键词： 小尾寒羊;VPS26A;生物信息学;表达分析;逆转运复合物

期刊名称： 中国畜牧杂志

ISSN： 0258-7033

年卷期： 2024 年 006 期

页码： 270-275

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为获得绵羊液泡蛋白分选26A（Vacuolar Protein Sorting 26A,VPS26A）基因CDS序列，确定其生物学功能，明确其在不同品种不同组织的表达差异，以新吉细毛羊和小尾寒羊为试验动物，以小尾寒羊皮肤组织cDNA为模板通过TA（T’s and A’s Method）克隆获得CDS区序列，并对序列进行生物信息学分析，预测其可能编码的蛋白质结构和功能；利用实时荧光定量PCR检测VPS26A基因在小尾寒羊和新吉细毛羊不同组织的表达差异。结果显示：VPS26A基因CDS序列全长为981 bp，编码327个氨基酸。绵羊VPS26A氨基酸序列与羚羊相似性最高，同源性为100%，与人的相似性最低，为99.4%；系统进化树结果显示，绵羊VPS26A与山羊和羚羊亲缘关系最近，与人和驴亲缘关系最远。VPS26A蛋白无跨膜结构域和信号肽，存在27个磷酸化位点和2个N-糖基化位点，主要分布在细胞质和核内体上。VPS26A蛋白二级结构预测结果显示，无规则卷曲、延伸链、α螺旋和β转角分别占45.87%、30.28%、18.35%和5.50%，与三级结构预测一致。实时荧光定量PCR结果显示，VPS26A基因在小尾寒羊肺脏中表达量最高，其次是皮肤，而在新吉细毛羊皮肤的表达量均最高，均显著高于其他组织。本研究为进一步阐述VPS26A基因功能奠定了基础。

分类号： S826.2

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