猪Ⅱ型圆环病毒广东分离株的全基因组克隆及序列分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 王贵平
作者: 王贵平;蒋智勇;宋长绪;高向阳;赵亚华;林志雄;朱道中
作者机构:
关键词: 猪Ⅱ型圆环病毒(PCV-2);基因组;克隆;序列分析
期刊名称: 中国预防兽医学报
ISSN: 1008-0589
年卷期: 2004 年 26 卷 04 期
页码:
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 根据GenBank中猪Ⅱ型圆环病毒 (PCV_2 )基因序列 ,设计两对特异性引物。将PCV_2广东分离株 (GD1株 )用PK15细胞系培养 ,从细胞培养物中提取病毒总DNA并以之为模板 ,用PCR方法分段扩增病毒全基因组 ,分别克隆到pMD18_T载体 ,对阳性质粒进行序列测定。用DNAstar对序列进行拼接 ,得到PCV_2GD1株基因组全序列 ,全长为 176 7个碱基 ,包涵 2个开放阅读杠 (ORF1和ORF2 ) ,分别编码与复制相关的Rep蛋白和结构蛋白Cap。通过BLAST对所测GD1株核苷核酸序列早国内外已登录GenBank中的PCV_2病毒核苷酸序更进行同源性比较 ,与PCV_2参考毒株的核苷酸同源性介于 94 4 %~ 99 7%之间 ,与德国株PCV_2 (AF2 0 1897)的同源性最高 ,为 99 7% ;与猪Ⅰ型圆环病毒 (PCV_1)参考株 (AY184 2 87)的同源性仅为 70 %。
分类号: S852.65
- 相关文献
[1]猪圆环病毒2型天津株的全基因组克隆与序列分析. 李海花,李秀丽,张莉,孙英峰,任卫科,路超,田向学. 2014
[2]猪圆环病毒2型山东株全基因组的克隆与序列分析. 柳美玲,秦晓冰,王爱华,牛晋国,单虎. 2008
[3]猪圆环病毒2型河北株的全基因组克隆与系统进化分析. 王光祥,郑海学,刘湘涛,尚佑军,常艳燕,靳野. 2008
[4]猪圆环病毒2型XJ-SW株全基因组的克隆与序列分析. 黄新,康立超,韩猛立,何延华,钟发刚. 2012
[5]猪圆环病毒2型甘肃株全基因组克隆及序列分析. 贾怀杰,王晓霞,房永祥,陈国华,李玩生,窦永喜,李克斌,瞿惠玲,景志忠. 2010
[6]猪圆环病毒2型甘肃兰州株全基因组序列的克隆及序列分析. 贾怀杰,景志忠,房永祥,王晓霞,陈国华,李克斌,窦永喜,瞿惠玲. 2010
[7]3株鸭肝炎病毒1型全基因序列分析. 杨维星,施少华,陈红梅,万春和,程龙飞,傅光华,林芳,林建生,苏敬良,黄瑜. 2010
[8]鸭圆环病毒基因组序列分析及其C1截短基因的原核表达. 施少华,陈珍,杨维星,傅光华,程龙飞,陈红梅,彭春香,黄瑜. 2009
[9]猪繁殖与呼吸综合征病毒Shanxi-6株全基因序列分析. 韩一超,刘文俊,姚敬明,吴忻,王娟萍,武守艳,陈剑波,孟帆,郭慧慧,杨丽华,雷宇平,樊振华. 2014
[10]新型鸭肝炎病毒分离株JFX08全基因组测定与分析. 赵立娜,马秀丽,李玉峰,黄兵,宋敏训,李建亮,崔言顺. 2010
[11]甘薯曲叶病毒福建省分离物的分子鉴定. 李华伟,刘中华,张鸿,林志坚,李国良,林赵淼,许泳清,邱永祥,罗文彬,纪荣昌,汤浩,邱思鑫. 2018
[12]樱桃谷鸭源鹅出血性多瘤病毒(GHPV)全基因组克隆与分析. 万春和,陈翠腾,刘荣昌,程龙飞,施少华,傅光华,陈红梅,傅秋玲,黄瑜. 2018
[13]三株猪2型圆环病毒甘肃分离株的全基因组序列分析. 马友记,柳纪省,李志勇,殷相平,杨彬,李发弟,张利. 2007
[14]高等植物线粒体基因组测序和序列分析. 李双双,薛龙飞,苏爱国,雷彬彬,王玉美,华金平. 2011
[15]减蛋综合征病毒NE4株全基因组序列测定与分析. 董春娜,李刚,邱文英,张坤,哈小琴. 2010
[16]蓖麻基因组Mlo基因家族成员的鉴定及其序列特征分析. 覃碧,王萌,刘巧玲,张宇. 2014
[17]猪嵴病毒福建株全基因克隆及序列分析. 修金生,胡崇伟,陈如敬,王斌,李涛,陈秋勇,林群群. 2013
[18]鸭圆环病毒PT07基因组序列测定与分析. 施少华,傅光华,程龙飞,陈红梅,万春和,陈珍,彭春香,林芳,黄瑜. 2010
[19]一株Asia1型口蹄疫病毒的全基因组序列测定及比较分析. 李爽,李勐,高明春,于力,周国辉,王君伟. 2008
[20]黄瓜绿斑驳花叶病毒安徽分离物全基因组序列测定及分析. 严丹侃,张海珊,郑红英,燕飞,章东方. 2016
作者其他论文 更多>>
-
一株高病毒载量PCV2毒株的基因组特征及序列分析
作者:常鑫;蒋智勇;卞志标;徐民生;杨冬霞;杨傲冰;翟少伦
关键词:猪圆环病毒2型(PCV2);遗传进化分析;ORF1基因;ORF2基因;B细胞表位;抗原指数
-
免套袋栽培富士苹果果实品质与树体结构相关性分析
作者:王贵平;陈汝;李强;翟浩;聂佩显;薛晓敏
关键词:免套袋;富士;果实品质;树体结构;枝类组成;相关性
-
“粤引早脆梨”在韶关市武江区的引种表现及优质丰产栽培技术
作者:薛海军;陆育生;林志雄
关键词:粤引早脆梨;引种;栽培技术;优质丰产;韶关市武江区
-
不同谱系D型流感病毒HEF蛋白N-糖基化位点和B细胞表位预测分析
作者:蒋智勇;周霞;李春玲;楚品品;勾红潮;李艳;卞志标;刘建营;翟少伦
关键词:D型流感病毒;谱系;HEF蛋白;N-糖基化位点;B细胞表位;预测
-
猪增生性肠炎的诊治
作者:徐民生;柯海意;杨冬霞;宋帅;勾红潮;张昆丽;蒋智勇;李艳;楚品品;翟少伦;简运华;李春玲
关键词:猪增生性肠炎;胞内劳森菌;诊断;综合防治
-
‘富士’苹果不套袋与套袋密度对树体光合特性的影响
作者:王贵平;薛晓敏;赵红强;陈汝;韩雪平;王金政
关键词:苹果树;套袋;树冠;光合作用;叶绿素;光照强度;气孔限制
-
'富士'苹果不套袋与套袋密度对树体光合特性的影响
作者:王贵平;薛晓敏;赵红强;陈汝;韩雪平;王金政
关键词:苹果树;套袋;树冠;光合作用;叶绿素;光照强度;气孔限制