铝处理下绣球实时荧光定量PCR内参基因筛选及验证

文献类型: 中文期刊

第一作者: 陈双双

作者: 陈双双;齐香玉;冯景;陈慧杰;王华娣;秦紫艺;邓衍明

作者机构:

关键词: 绣球;铝处理;内参基因;表达稳定性

期刊名称: 华北农学报

ISSN:

年卷期: 2021 年 002 期

页码: 9-18

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为筛选适合铝处理下绣球中稳定表达的内参基因,在转录组数据分析的基础上,以Al2(SO43处理下绣球铝敏感品种Bailer(商品名:Endless SummerTM,中文名译为无尽夏)和不敏感品种Ruby(中文名译为红宝石)的不同组织为材料,分析10个候选内参基因(5个传统内参基因和5个新基因)的表达水平,并利用geNorm、NormFinder、BestKeeper、ΔCt及RefFinder 5个程序分析候选内参基因的表达稳定性。结果表明,β-TUB(β-微管蛋白)和UPL7(E3泛素蛋白连接酶)的表达水平较高,而且相对较稳定;表达稳定性分析结果显示,在Al2(SO43处理下Bailer中最适内参基因为UPL7和β-TUB,其次是ACT7,Ruby中最适内参基因为β-TUB和UBP15,其次是UPL7;适用于不同组织器官以及所有样本的最适内参基因同样为β-TUB、UBP15和UPL7。因此,β-TUB和UPL7为铝处理下绣球实时荧光定量PCR最适内参基因;以β-TUB、UPL7和β-TUB+UPL7作为内参基因时,绣球铝转运蛋白基因HmVALT的表达模式一致。

分类号: S685.99

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