橡胶树胶孢炭疽菌T-DNA标记基因Lv1初步分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 郑肖兰
作者: 郑肖兰;李秋洁;许沛冬;吴伟怀;郑金龙;习金根;梁艳琼;李锐;张驰成;郑行恺;贺春萍;易克贤
作者机构:
关键词: 胶孢炭疽菌;T-DNA;Lv1;功能分析
期刊名称: 热带作物学报
ISSN: 1000-2561
年卷期: 2017 年 38 卷 02 期
页码: 328-334
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 通过对实验室已构建的胶孢炭疽菌T-DNA突变体库中各突变体致病力的测定,获得致病力丧失突变菌株T-900,利用TAIL-PCR克隆标记基因侧翼序列,进行比对和序列分析,获取假设基因Lv1的全序列,采用生物信息学方法进行Lv1基因预测及功能分析,最后通过敲除野生型菌株RC178中的基因Lv1进行功能分析。结果表明,获取的假定基因Lv1全序列共4 450 bp,基因预测显示T-DNA侧翼序列位于预测基因的1 727 bp处,正好处于预测基因的第1个外显子内;并且推测该基因为组蛋白H3基因,含有2个内含子,3个外显子;功能验证结果发现敲除突变体△T-900-16与T-900致病力表现一致,推测Lv1基因与RC178的致病力相关。
分类号: S763.7
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