鼠尾藻基因表达对干露胁迫响应的初步研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘福利

作者： 刘福利;王飞久;孙修涛;汪文俊;梁洲瑞;马兴宇

作者机构：

关键词： 鼠尾藻;干露胁迫;基因表达;RNA-Seq

期刊名称： 水产学报

ISSN： 1000-0615

年卷期： 2014 年 38 卷 02 期

页码： 282-288

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为阐释鼠尾藻对干露胁迫的适应机制,本研究应用RNA-Seq技术从基因表达水平上研究了鼠尾藻对干露胁迫的分子响应过程。对照组CO1获得17 532 085条clean reads,3 h干露胁迫的处理组DR2获得14 479 820条clean reads。CO1中检测到的表达基因数为20 966个,DR2中检测到的表达基因数为20 588个。CO1和DR2组间差异表达的基因总数为476个;相对于CO1,DR2中表达上调的基因数为135个(28.36%),表达下调的基因数为341个(71.64%)。GO分析共富集得到915个GO term,其中143个GO term涉及的基因表达上调,860个GO term涉及的基因表达下调。pathway富集分析发现104个代谢途径被富集,其中表达上调基因参与的代谢途径数为10个,表达下调基因参与的代谢途径为101个。差异表达基因编码热休克蛋白家族、抗氧化酶系统、与蛋白合成、加工及降解的相关因子等。以上结果表明,鼠尾藻对干露胁迫的分子响应是一个复杂的过程,涉及众多生化代谢途径和信号转导途径。

分类号： S968.4

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