海南岛火焰兰SSR标记开发、遗传多样性与群体结构分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 赵慧琪

作者： 赵慧琪;李栋梁;赵慧琳;吴芳芳;黄赛;张永豪;张浪;杨珺;任军方

作者机构：

关键词： 火焰兰;SSR标记;遗传多样性;群体结构

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2023 年 007 期

页码： 2300-2310

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了开发火焰兰（Renanthera coccinea）的SSR引物，进而开展海南岛火焰兰的种质鉴定、遗传多样性和群体结构分析。本研究采用三代测序技术首先获得火焰兰参考转录组，然后开发了火焰兰的SSR引物，最后基于SSR引物利用分子变异分析（AMOVA）、非加权组平均法（UPGMA）聚类、主坐标（PCoA）与群体结构分析等方法对来自海南岛不同地理分布的396份火焰兰资源进行研究。结果表明，所开发的17对三核苷酸多态性SSR引物能够有效地鉴别所收集的396份火焰兰种质。AMOVA分析显示，火焰兰群体间呈现极高程度的遗传分化，并且群体内的遗传变异高于群体间的遗传变异。群体结构分析显示，来自不同地理分布的海南岛火焰兰存在3个不同的基因库，而且绝大多数群体是独立进化的，只有少数群体存在遗传混合，这一结果与UPGMA和PCoA分析的结果基本一致。综上可知，本研究新开发的17对SSR引物有效鉴定了396份海南岛火焰兰种质，揭示了其遗传多样性和群体遗传结构，对火焰兰的种质资源保护和育种计划具有非常重要的参考价值。

分类号： S682.31

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