鲢InDel-RFLP标记开发及其在连锁图谱构建中的应用

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张鹏

作者： 张鹏;杨官品;张立楠;危起伟;邹桂伟

作者机构：

关键词： 鲢(Hypophthalmichthys molitrix);碱基插入缺失;限制性片段长度多态性;连锁图谱

期刊名称： 淡水渔业

ISSN： 1000-6907

年卷期： 2011 年 41 卷 02 期

页码： 43-48+50+29

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 基于随机测序的鲢(Hypophthalmichthys molitrix)基因组片段,尝试开发基于InDel的限制性片段长度多态性标记(InDel-RFLP)。结果显示:共133个片段中,65个在一个野生鲢群体(该野生鲢群体采自长江流域荆州段,31个个体)中表现多态性。共检测到163个等位基因,每位点等位基因数从2到4不等,平均2.5个。65个多态性标记中,有35个被添加到鲢SSR-AFLP性别平均连锁图谱上。长约2 kb的片段比长约1 kb的片段更适用于InDel-RFLP标记开发。设计特异引物,扩增基因组片段,用4种限制性内切酶(BsuR I、Hha I、Taq I和Vsp I)之一切成适宜聚丙烯酰胺凝胶电泳分离的小片段,电泳分离、银染分型。该标记系统避免了对InDel精确定位的困难,通过高分辨PAGE分型,可为鲢连锁图谱构建和性状定位提供丰富的标记位点。

分类号： S917.4

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