家蚕转录因子AP-4基因cDNA的分子克隆与生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李佳梅

作者： 李佳梅;赵浩勤;张国政;夏定国;张业顺;唐顺明;沈兴家

作者机构：

关键词： 家蚕;转录因子AP-4;cDNA末端快速扩增;基因克隆;生物信息学

期刊名称： 蚕业科学

ISSN： 0257-4799

年卷期： 2008 年 34 卷 02 期

页码： 211-218

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： AP-4(activator protein 4)是一种转录因子,在生物的生长发育中有重要作用。根据家蚕表达序列标签(EST)并利用cDNA末端快速扩增(RACE)方法克隆了家蚕AP-4(Bombyx mori activator protein4)基因,结合生物信息学方法对所获的序列进行开放阅读框、序列同源性分析,预测了AP-4蛋白的理化性质。获得的家蚕AP-4基因cDNA的全长为1621bp,其开放阅读框为996bp,编码331个氨基酸,基因由3个外显子和2个内含子组成。同源性比对表明该基因推导的氨基酸序列与棉铃虫AP-4和谷蛀虫AP-4推测的蛋白同源性分别为76%和54%,第45-99位氨基酸序列是一个典型的保守结构域。实时定量RT-PCR显示该基因在所检测家蚕的各发育时期中,除幼虫1龄和蛹期第4天无表达外,其它时期均有表达,其中幼虫3龄和4龄期的表达量较高。

分类号： S881

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