亚麻EST-SSR信息分析与标记开发

文献类型： 中文期刊

第一作者： 龙松华

作者： 龙松华;李翔;邓欣;王玉富;王进;何东锋;陈信波

作者机构：

关键词： 亚麻;分子标记;EST;SSR

期刊名称： 武汉植物学研究

ISSN： 1000-470X

年卷期： 2010 年 28 卷 05 期

页码： 634-638

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 与基因组SSR相比,以EST为基础的EST-SSR分子标记具有自身的优点。本研究从11240条亚麻(Linum sitatissmum L.)EST序列中检索出877条含有SSR的序列,其出现频率为7.8%。其中以三核苷酸重复出现的频率最高,占总SSR序列的60.1%;其次是二核苷酸重复,占21.9%;四、五和六核苷酸重复占18%。根据这些含SSR的EST序列共设计了73对SSR引物,在8份亚麻材料间通过PCR扩增检测,有63对引物扩增出清晰条带,引物可用率86.3%;有17对引物在8份亚麻材料间显现出多态性,占可扩增引物的26.3%。

分类号： S563.2

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