绿壳蛋鸡与白来航蛋鸡microRNA变异及其靶基因预测分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 管毓渝

作者： 管毓渝;廖荣荣;王振;赵静;陈振亮;张哲;肖倩;孙浩;王起山

作者机构：

关键词： 绿壳蛋鸡;白来航蛋鸡;microRNA;SNP;靶基因预测;富集分析

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2016 年 43 卷 06 期

页码： 1413-1421

收录情况： 北大核心

摘要： 本研究旨在分析绿壳蛋鸡与白来航蛋鸡microRNA变异及其靶基因,将已鉴定的microRNA与预测microRNA组成全基因组的microRNA,并通过与GGRS得到的两种鸡群体SNP位点进行映射,挖掘含SNP的microRNA。利用生物信息学的方法,对含SNP的microRNA进行靶基因预测,并对直接含有SNP的maturemicroRNA进行聚焦。将这些靶基因进行富集,一共得到22个GO分类和10条KEGG信号通路与3个主要IPA调控网络,发现其在与生长相关的mTOR信号通路、Wnt信号通路、生长激素受体网络、胰岛素样生长因子Ⅰ受体网络得到了富集,与产蛋性状相关的卵母细胞减数分裂信号通路、黄体酮卵母细胞成熟信号通路得到了富集。此研究方法和结果可以给后期研究提供参考。

分类号： S831

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