高温胁迫下仿刺参体壁组织的转录组差异分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 孙红娟

作者: 孙红娟;蒋经伟;宋钢;陈仲;关晓燕;高杉;王摆;姜苹哲;李佩佩;岳冬梅;肖瑶;潘永嘉;姜冰;董颖

作者机构:

关键词: 仿刺参;高温;转录组测序;差异表达基因;热休克蛋白

期刊名称: 水产科学

ISSN: 1003-1111

年卷期: 2025 年 44 卷 004 期

页码: 553-561

收录情况: 北大核心

摘要: 为探明仿刺参应对高温胁迫的调控机制,采用Illumina HiSeq技术对高温组(30℃)和对照组(24℃)仿刺参幼参[(5.0±0.6) g]体壁样本进行转录组测序分析。高温组和对照组共产生了2920个差异表达基因,包括1342个上调表达基因和1578个下调表达基因。差异表达基因的KEGG信号通路分析表明,其显著富集在核糖体、内质网蛋白加工、病原互作、糖酵解和氧化磷酸化等通路中。对上下调表达基因在不同信号通路分布的研究发现,仿刺参受到热胁迫后体内信号转导活动增加,蛋白翻译活动减少,而对已有蛋白的折叠加工活动增加,整体的能量代谢下降。实时荧光定量PCR检测结果显示,5个基因在对照组和高温组的表达量相关系数R为0.87,表明转录组测序结果可靠。热休克蛋白在热胁迫响应过程中发挥重要作用,HSP90β和HSP70A/B2基因的高表达促进了蛋白的正确折叠,增强了耐热性。仿刺参幼参在应对高温胁迫时对已有蛋白的折叠加工活动增加,减少了蛋白的翻译和能量消耗,这是机体维护体内稳态、保护自身免受损伤的一种策略。对热胁迫相关基因SNP位点的分析,有助于分子标记的开发和选育耐高温苗种。

分类号: S917.4

  • 相关文献

[1]双孢蘑菇6个菌株不同发育阶段的转录组分析. 施肖堃,卢园萍,蔡志欣,郭仲杰,陈美元,廖剑华. 2019

[2]基于转录组学的不同色系蝴蝶兰花色苷差异积累分析. 张加强,史小华,刘慧春,马广莹,邹清成,朱开元,周江华,毛军铭. 2018

[3]基于RNA-Seq筛选ALV-J感染汶上芦花鸡肝差异表达致病相关基因. 张会永,吴井生,杨剑波,俞燕,薛倩,殷建玫,朱云芬,朱静,苏一军,李国辉,韩威. 2020

[4]鸭胚胎发育中后期胸肌发育阻滞的RNA-seq分析. 刘宏祥,徐文娟,朱春红,陶志云,宋卫涛,章双杰,李慧芳. 2018

[5]基于瘤胃转录组探究双峰驼沙漠适应性分子机制. 方艳,周俊文,关伟军,蒋琳,浦亚斌,赵倩君,何晓红,马月辉. 2021

[6]利用RNA-Seq技术分析草鱼生长性状相关基因和SNP标记. 孙雪,李胜杰,姜鹏,杜金星,周家辉,白俊杰. 2021

[7]芝麻根系响应铝胁迫的比较转录组分析. 梁俊超,赵云燕,颜小文,颜廷献,王郅琪,孙建,饶月亮,周红英,乐美旺. 2023

[8]鸭胚胎发育中后期胸肌发育阻滞的RNA-seq分析. 刘宏祥,徐文娟,朱春红,陶志云,宋卫涛,章双杰,李慧芳. 2018

[9]基于转录组测序技术挖掘大豆蛋白质合成相关基因. 郭静文,史晓蕾,刘茜,赵青松,邸锐,刘兵强,闫龙,王凤敏,张孟臣,赵宝华,杨春燕. 2019

[10]哈茨木霉Th-33厚垣孢子形成过程的转录组变化分析. 李梅,张林,庞莉,孙青,蒋细良. 2015

[11]基于转录组测序筛选鸡皮肤毛囊性状相关基因和关键通路. 陈春,魏岳,黄聪,黎观红,谢金防,武艳平. 2023

[12]不同磷酸盐浓度下浮游虫黄藻的转录组比较分析. 李月,王云龙,欧阳珑玲. 2022

[13]长日照条件下2个热带玉米自交系的转录组差异分析. 高媛,王小利,涂亮,刘鹏飞,郭向阳,王安贵,祝云芳,吴迅,陈泽辉. 2022

[14]野生稻基因导入系W6023对白叶枯菌的抗谱及转录组差异表达基因分析. 张明伟,徐飞飞,郝巍,王春连,赵开军. 2017

[15]桃响应葡萄座腔菌侵染的转录组学分析. 刘勇,王富荣,王会良,艾小艳,朱炜,孙中海,吕亮,龚林忠,何华平. 2024

[16]转录组测序技术在猪繁殖与呼吸综合征病毒研究中的应用. 梁婉,周丹娜,彭忠,杨克礼,段正赢,郭锐,刘威,吴斌,陈文杰,孟丽,田永祥. 2019

[17]红望天眼金鱼皮肤变色机制的转录组学分析. 李荣妮,王赛赛,田仲,孙砚胜,张博,张欣. 2022

[18]基于转录组测序的金银花提取物抗鸽源新城疫病毒感染的作用机制研究. 莫红芳,石宗承,杨燕燕,俸云,虞霖田,石德顺,熊晓妍. 2024

[19]西方蜜蜂工蜂不同虫态发育的转录组学分析. 宋文菲,胡宗文,苗春辉,余玉生,杨爽,李亚辉. 2022

[20]基于转录组测序筛选大口黑鲈食性驯化相关基因和SNP标记. 邵嘉棋,杜金星,雷彩霞,李胜杰,董传举,张猛,李学军. 2022

作者其他论文 更多>>