高温胁迫下仿刺参体壁组织的转录组差异分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 孙红娟
作者: 孙红娟;蒋经伟;宋钢;陈仲;关晓燕;高杉;王摆;姜苹哲;李佩佩;岳冬梅;肖瑶;潘永嘉;姜冰;董颖
作者机构:
关键词: 仿刺参;高温;转录组测序;差异表达基因;热休克蛋白
期刊名称: 水产科学
ISSN: 1003-1111
年卷期: 2025 年 44 卷 004 期
页码: 553-561
收录情况: 北大核心
摘要: 为探明仿刺参应对高温胁迫的调控机制,采用Illumina HiSeq技术对高温组(30℃)和对照组(24℃)仿刺参幼参[(5.0±0.6) g]体壁样本进行转录组测序分析。高温组和对照组共产生了2920个差异表达基因,包括1342个上调表达基因和1578个下调表达基因。差异表达基因的KEGG信号通路分析表明,其显著富集在核糖体、内质网蛋白加工、病原互作、糖酵解和氧化磷酸化等通路中。对上下调表达基因在不同信号通路分布的研究发现,仿刺参受到热胁迫后体内信号转导活动增加,蛋白翻译活动减少,而对已有蛋白的折叠加工活动增加,整体的能量代谢下降。实时荧光定量PCR检测结果显示,5个基因在对照组和高温组的表达量相关系数R为0.87,表明转录组测序结果可靠。热休克蛋白在热胁迫响应过程中发挥重要作用,HSP90β和HSP70A/B2基因的高表达促进了蛋白的正确折叠,增强了耐热性。仿刺参幼参在应对高温胁迫时对已有蛋白的折叠加工活动增加,减少了蛋白的翻译和能量消耗,这是机体维护体内稳态、保护自身免受损伤的一种策略。对热胁迫相关基因SNP位点的分析,有助于分子标记的开发和选育耐高温苗种。
分类号: S917.4
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