优秀单板U型场地滑雪运动员外周血淋巴细胞cDNA文库构建及ESTs分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张泽彪

作者： 张泽彪;赵玉华;周文婷;汪宇峰;赵晨琼;关伟军;朱志强

作者机构：

关键词： 单板U型场地滑雪;外周血淋巴细胞;全长cDNA文库;表达序列标签

期刊名称： 首都体育学院学报

ISSN： 1009-783X

年卷期： 2017 年 03 期

页码： 254-258

收录情况： 北大核心

摘要： 构建一个优秀单板U型场地滑雪运动员血液的cDNA文库,经测序从中获取大量的表达序列标签(Expressed Sequence Tags)ESTs,用于基因筛选和功能预测。方法:通过对多名优秀冰雪运动员血液样品的总RNA进行提取、混合总RNA,合成双链cDNA、蛋白酶K消化、Sfi1酶切并连接载体、λ噬菌体的包装,经扩增最终获得优秀冰雪运动员cDNA文库;随后从文库中随机挑选500个克隆提交至北京诺赛基因组研究中心有限公司进行测序,测序结果利用Chromas软件去低质量样品,使用Gen Bank中的BLAST功能对所获序列进行比对获取相关信息,将获得的ESTs信息提交PAN THR和GO(Gene O ntology)生物信息数据库进行基本归类分析,从中获取运动员c DN A文库中所涵盖的重要遗传信息。结果:得到滴度分别为1.32×106 pfu/m L和1.65×1010 pfu/m L的未扩增文库和扩增后文库,扩增后文库的重组率为90.6%;得到长度在300~1 100 bp序列360个,平均长度606 bp;通过BLAST比对得出201条具有注释的基因信息,利用PANTHER数据库基本分析发现这些基因分布在27个pathway上,其中TXN、MDH1、AR L1、AR PC3、ACTG1等基因分别分布在参与新陈代谢、氧化应激反应、心血管系统机能等相关联的信号通路上,推测其可能与运动能力存在关联。通过GO分析对所测序列进行归类得到在该数据库中具有功能注释的基因143个,参与31项不同功能,主要包括细胞组分、分子功能和生物过程。结论:构建了一个全长的运动员cDNA文库,其质量符合构建cDNA文库的标准。

分类号： G804.2

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