军曹鱼MHC-Ⅱα基因全长cDNA的克隆及其组织表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 茅莉娜

作者： 茅莉娜;冯娟;李玉谷;侯月娥;郭志勋;许海东

作者机构： 华南农业大学兽医学院;中国水产科学研究院南海水产研究所

关键词： 军曹鱼;MHC-Ⅱα;全长cDNA;mRNA表达

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2010 年 37 卷 10 期

页码： 48-57

收录情况： 北大核心

摘要： 本研究根据其他鱼类MHC-Ⅱα基因的保守序列设计兼并引物,运用同源克隆和末端快速扩增方法扩增了军曹鱼MHC-Ⅱα基因的全长cDNA序列,并对cDNA及其氨基酸序列进行了分析,比较了军曹鱼和其他物种的MHC-Ⅱα氨基酸序列的差异,分析了军曹鱼MHC-Ⅱα基因的组织分布及经LPS刺激后头肾组织中MHC-Ⅱα基因的表达变化。结果表明,军曹鱼MHC-ⅡαcDNA全长998 bp,包括53 bp的5′末端非编码区(5′UTR)、234 bp的3′末端非编码区(3′UTR)及711 bp的开放阅读框(ORF),编码236个氮基酸,其蛋白质分子质量约为25.94 ku,等电点为4.39;军曹鱼MHC-Ⅱα蛋白质序列具有一些重要的特征,包括前导肽、α1、α2、CP/TM/CYT区和保守的半胱氨酸等;军曹鱼MHC-Ⅱα与鼠、人及其它鱼类的氨基酸同源性在25.0%~69.5%之间。Real-ti me PCR检测结果显示,MHC-Ⅱα基因在正常军曹鱼组织中均有表达,但其表达量在各种组织中存在差异,其中较强表达于头肾、鳃,中等程度表达于脾脏、肠,在心脏、脑、肌肉中表达较弱;经LPS刺激后,头肾中MHC-Ⅱα基因表达下调。

分类号： S917.4`Q78

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