iTRAQ结合2D LC-MS/MS技术鉴定健康和死皮橡胶树胶乳差异表达蛋白

文献类型： 中文期刊

第一作者： 袁坤

作者： 袁坤;王真辉;周雪梅;邹智;杨礼富

作者机构：

关键词： 橡胶树;死皮;iTRAQ;2D LC-MS/MS;细胞程序性死亡;橡胶生物合成

期刊名称： 江西农业大学学报

ISSN： 1000-2286

年卷期： 2014 年 03 期

页码： 650-655

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 橡胶树死皮(Tapping panel dryness,TPD)是限制天然橡胶产量提高的关键因子之一,鉴定健康和死皮橡胶树胶乳差异表达蛋白对阐明橡胶树死皮发生机制具有重要意义。研究首次采用同位素标记相对和绝对定量(Isobaric tags for relative and absolute quantitation,iTRAQ)结合二维液相色谱串联质谱(Two-dimensional liquid chromatography-tandem mass spectrometry,2D LC-MS/MS)技术对健康和死皮橡胶树胶乳蛋白质组的差异进行研究。结果显示,有16个蛋白差异表达,其中,在死皮树中表达上调的蛋白有2个,下调的蛋白有14个。进一步应用实时荧光定量RT-PCR对其中6个差异蛋白的基因进行表达分析,发现其表达趋势与蛋白质组水平的研究结果一致。功能分析显示,这些差异蛋白主要与细胞程序性死亡(如TCTP、HSP70、CaM、cysteine protease等)和橡胶生物合成(如SRPP和diphosphomevelonate decarboxylase)相关,从蛋白质组学角度进一步验证了橡胶树死皮发生过程中涉及细胞程序性死亡和橡胶生物合成途径。

分类号： S794.1

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