鸡新城疫病毒F48E9强毒株NP基因的序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 陈珍

作者： 陈珍;施少华;程龙飞;傅光华;陈红梅;万春和;林芳;林建生;黄瑜

作者机构：

关键词： 鸡新城疫病毒;F48E9株;NP基因;序列分析

期刊名称： 福建农业学报

ISSN： 1008-0384

年卷期： 2009 年 24 卷 05 期

页码： 385-389

摘要： 根据GenBank登录的鸡新城疫病毒NP基因序列设计引物,利用RT-PCR对F48E9强毒株NP基因进行扩增,将扩增产物经纯化后连入pMD18-T载体,通过PCR和酶切鉴定出阳性重组质粒,经测序后获得F48E9 NP基因序列。经分析发现该基因的ORF总长为1 470 bp,编码489 aa,NP蛋白有4个高度保守的Cys位点,分别位于第55、78、139、213位,且在401～440位和461～481位区域变异较大。将F48E9株与19株参考毒株的相应序列进行比较得到核苷酸序列同源性为87.9%～92.3%,氨基酸序列同源性较高,为92.2%～98.0%,遗传进化分析表明F48E9株相对独立,与参考毒株的遗传距离较远。

分类号： S852.65

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