基于脾脏转录组筛选北京油鸡和广明白鸡抗热应激相关功能基因

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王子渲

作者： 王子渲;王巧;张锦;Astrid Lissette Barreto Sánchez;郑麦青;李庆贺;崔焕先;安炳星;赵桂苹;文杰;李和刚

作者机构：

关键词： 北京油鸡;广明白鸡;热应激;差异表达基因;加权基因共表达网络分析

期刊名称： 畜牧兽医学报

ISSN： 0366-6964

年卷期： 2023 年 005 期

页码： 1905-1914

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 旨在通过对北京油鸡（BY）和“广明2号”白羽肉鸡B系（广明白鸡，GM）在热应激和正常饲养条件下的脾脏转录组进行分析，鉴定两鸡种在应对热应激时的差异表达基因和信号通路，解析不同鸡种耐热性能差异的分子调控机制。试验动物采用相同饲养条件下的25日龄北京油鸡和广明白鸡，测定异嗜性粒细胞与淋巴细胞的比值（H/L）、超氧化物歧化酶（SOD）和总抗氧化能力（T-AOC）等表型数据，采集脾脏组织进行转录组测序（RNA-Seq）。基于RNA-Seq数据，结合表型进行加权基因共表达网络分析（WGCNA）,筛选出与性状相关性较高的模块与基因。脾脏转录组测序结果表明，热应激组相比于对照组，北京油鸡中共鉴定到313个差异表达基因，其中169个上调表达，144个下调表达；广明白鸡中鉴定到235个差异表达基因，其中152个上调表达，83个下调表达。利用WGCNA分析，在北京油鸡中筛选出2个与H/L相关性较高的模块，在广明白鸡中筛选出4个与H/L和T-AOC强相关的模块。通过筛选模块中的Hub基因，发现两品种中均存在TRIM29基因，说明该基因可能在抗热应激方面发挥重要作用。本研究通过转录组分析，揭示了不同鸡种在热应激下基因的表达差异规律，并鉴定到与耐热相关的候选基因，为进一步研究鸡的耐热机制提供了新的思路和线索。

分类号： S831.2

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