小麦细胞分裂素受体基因TaHK1的生物信息学及表达特性分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 孙丽静
作者: 孙丽静;赵慧;吕亮杰;张颖君;胡梦芸;刘茜;李辉
作者机构:
关键词: 小麦;细胞分裂素受体;TaHK1;生物信息学分析;基因表达
期刊名称: 华北农学报
ISSN: 1000-7091
年卷期: 2019 年 04 期
页码: 75-82
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 细胞分裂素在植物发育和应对盐渍、干旱等非生物胁迫的过程中均扮演着重要的角色。为了研究小麦细胞分裂素受体基因的功能,利用已知的拟南芥细胞分裂素受体基因AHK4(At2g01830)为参考序列,使用同源克隆的方法从小麦基因组中得到同源性最高的基因TRIAE_CS42_4DS_TGACv1_362760_AA1181940(Ensembl Plants),命名为TaHK1。生物信息学分析表明,TaHK1位于小麦4D染色体上,编码的蛋白由996个氨基酸组成,分子质量为109. 70 ku,等电点为5. 71; TaHK1蛋白二级结构由α-螺旋、无规则卷曲、延伸链和β-转角4种构象组成;亚细胞定位预测该蛋白定位于细胞膜的可能性较大,跨膜结构域预测其具有2个跨膜域;蛋白保守结构域分析发现,TaHK1具有典型的细胞分裂素受体的完整结构域,并且含有87个磷酸化位点。表达谱分析显示,TaHK1在根、茎、叶、雄蕊和小穗等各个组织有广泛表达;此外,TaHK1表达量受低磷胁迫和多种病原菌侵染诱导,而受干旱胁迫抑制,推测其在小麦生长发育、抵御干旱胁迫和病原菌侵染过程中可能发挥重要作用。
分类号: S512.1
- 相关文献
[1]小麦TaMICU1-6A基因的克隆、生物信息学及表达分析. 李欣,李鲁华,任明见,安畅,洪鼎立,赵鹏鹏,徐如宏. 2024
[2]大白菜PHK4基因的功能初探. 李丹,朱振兴,王春语. 2015
[3]灰毡毛忍冬MADS-box基因家族AGL15基因的克隆、生物信息学和表达分析. 蔡嘉洛,朱贻霖,陈林,樊悦,刘峰,张亚丽,欧阳琳,刘湘丹. 2016
[4]糜子抗白粉病基因(Mlo)编码蛋白的序列特征及表达分析. 石甜甜,何杰丽,秦明月,陈凌,王海岗,王瑞云,乔治军. 2018
[5]玉米蔗糖转运蛋白基因ZmSUT4克隆及其低温胁迫下的表达模式. 弓雪,姜敏,齐欣,刘欣芳,卢生乔,陈坤,刘亚利,张述宽,马涛,杨耀迥. 2019
[6]‘富士’苹果Ca~(2+)/H~+反向转运蛋白基因生物信息学及表达模式分析. 程玉豆,冯云霄,关军锋. 2015
[7]荔枝漆酶(LAC)基因家族鉴定及表达分析. 李郑华,姜成东,王鹏,李芳,王树军,刘耀婷,李焕苓,王果,王家保. 2023
[8]绵羊MYL基因家族的鉴定与组织表达分析. 杨杨,余乾,刘昱成,杨华,赵卓,王立民,周平,杨庆勇,代蓉. 2024
[9]甘薯CLE多肽家族的全基因组鉴定和IbCLE12的克隆及抗旱性表达分析. 周媛媛,赵春玲,侯夫云,李爱贤,秦桢,王庆美,董顺旭. 2023
[10]甘蔗ScHAK10基因克隆及表达分析. 罗海斌,蒋胜理,黄诚梅,曹辉庆,邓智年,吴凯朝,徐林,陆珍,魏源文. 2018
[11]石榴蔗糖代谢相关酶SPS和INV基因家族鉴定与表达分析. 冯立娟,李英朋,王传增,尹燕雷,郭琳,谭伟. 2024
[12]高粱SBP基因家族鉴定及干旱胁迫下的表达模式分析. 姜昱雯,陈满静,赵应,任艳,周棱波,沈佳奇,邵明波. 2024
[13]水稻WOX家族基因鉴定及其种子在逆境萌发中的表达分析. 张琪,张爱霞,贾俊婷,赵华,刘军,陈兵先. 2022
[14]辣椒组蛋白去乙酰化基因家族分离鉴定及表达分析. 李涛,徐小万,黎振兴,王恒明,李植良,李颖. 2015
[15]大白菜LACS家族基因鉴定与表达分析. 王荣花,王树彬,刘栓桃,张志刚,李巧云,王立华,赵智中. 2022
[16]水稻核糖体失活蛋白家族基因OsRIP8的生物信息学与功能分析. 徐娅,黄佑岗,李树杏. 2024
[17]ghr-miR160负调控棉花叶片衰老机理研究. 段珊,喻树迅,窦玲玲,程帅帅,郭亚宁,庞朝友,马启峰,魏恒玲,范术丽,王寒涛. 2018
[18]向日葵查尔酮合酶HaCHS基因的克隆与逆境应答. 马立功,张匀华,孟庆林,石凤梅,刘佳,李易初,王志英. 2016
[19]桑黄9个萜类合成酶基因的鉴定及表达分析. 李云琴,王毅,张子蕴,原晓龙,杨焱,杨文忠. 2021
[20]甘蔗ScHAK9基因克隆及表达分析. 罗海斌,黄诚梅,蒋胜理,曹辉庆,邓智年,吴凯朝,徐林,陆珍,魏源文. 2018
作者其他论文 更多>>
-
导入巴克夏血统苏紫猪生长曲线拟合研究
作者:廖超;程金花;李娟;赵为民;李辉;戴超辉;付言峰
关键词:苏紫猪;生长曲线;生长拐点;拟合
-
山竹和木豆提取物对肉鸡生长性能、血浆生化指标、肠道健康和肉品质的影响
作者:范秋丽;陶正国;李辉;苟钟勇;王一冰;林厦菁;叶金玲;张赛;蒋守群
关键词:山竹提取物;木豆提取物;818肉鸡;生长性能;血浆生化指标;肠道健康;肉品质
-
气相色谱-串联质谱法测定花椒中106种农药残留及膳食暴露风险评估
作者:陈敏;尹全;邓强;刘茜;张义蓉;杨晓凤
关键词:气相色谱-串联质谱;花椒;固相萃取;农药多残留;膳食风险评估
-
国审高产节水小麦新品种-冀麦691
作者:吕亮杰;赵爱菊;刘玉平;李辉;陈希勇
关键词:
-
水牛早孕诊断方法比较研究
作者:黄荣春;谭正准;梁淦;李辉;黄健;鄢胜飞;曾令湖;潘伟军;卢瑛;覃广胜
关键词:水牛;早孕诊断;孕酮;雌二醇;ELISA法
-
基于DEM-MBD耦合的滚勺式精量穴播器成穴器运动参数优化
作者:王尊;赵武云;石林榕;孙步功;孙伟;戴飞;周刚;郭军海;饶罡;李辉
关键词:穴播器;成穴器;DEM-MBD耦合;仿真优化
-
小麦数字化育种系统开发研究
作者:侯亮;孙海芳;齐浩;李偲;李甜甜;吕亮杰
关键词:作物育种;数字化;小麦