无花果病毒CP基因克隆及遗传多样性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 陈伟

作者： 陈伟;薛婷;李亚娟;王瑞鑫;玉山江·麦麦提

作者机构： 山西师范大学生命科学学院;铜仁市农业科教信息站;西安国际陆港园林景观有限公司;新疆农业科学院植物保护研究所/农业部西北荒漠绿洲作物有害生物综合治理重点实验室

关键词： 无花果;FMV;CP基因;遗传多样性

期刊名称： 山西农业科学

ISSN： 1002-2481

年卷期： 2023 年 51 卷 011 期

页码： 1245-1251

摘要： 无花果花叶病毒(Fig mosaic virus,FMV)是一种RNA病毒,严重影响无花果的品质与产量.2019-2020年连续2 a从山西省临汾市无花果基地随机采集被FMV感染的新鲜无花果叶片119份,经RT-PCR获得CP基因,并进行序列分析,通过分析FMV分离株的遗传变异和种群结构,从多维度分析FMV的遗传多样性,旨在为无花果花叶病毒的分类、分子特征、进化机制以及致病机理的研究奠定基础,为解释FMV病毒分子结构、感染率高和进化程度提供有力证据.RT-PCR鉴定结果证实,53份样品为FMV阳性,从阳性样品中分离、测序、克隆得到12个新的FMV分离物;将12个分离物与在线数据比对,获得在线的37个分离物;对49个分离物进行系统发育分析得出,这些分离物来自10个国家,分布范围广,根据亲缘关系分为6个组,且与地理位置无关.进一步分析核酸和氨基酸一致性,49个CP基因核苷酸一致率和氨基酸一致率分别为 91.41%~100%和 89.33%~100%.结果发现,CP基因在进化过程中具有高度保守性且突变率较低.偏离中立性检验显示,FMV种群极大可能处于种群扩张状态.选择压和重组分析结果表明,负向选择可能是FMV分子变异的重要原因.

分类号： S432.4+1%S663.3

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