杧果PARMS反应体系的建立与优化

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘静萍

作者： 刘静萍;肖熙鸥;周开兵;柳凤;张国辉;普金安;张翠英;沐云松

作者机构：

关键词： 杧果（Mangifera indica L.）;SNP;PARMS;体系建立

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2023 年 021 期

页码： 7071-7077

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 五引物扩增受阻突变体系（penta-primer amplification refractory mutation system,PARMS）是基于PCR反应的最新基因分型技术，构建杧果PARMS分型体系对杧果种质资源分类和品种选育均有重要意义。本研究以杧果基因组DNA为模板，对PARMS体系的反应体积、引物浓度、DNA浓度进行调整优化，以期建立最佳的杧果PARMS分型反应体系，同时利用48份杧果种质对优化体系进行了验证。结果表明：杧果PARMS分型反应体系的最佳体积为4μL：包含2μL 2×PARMS Master Mix,1μL DNA模板（稀释100倍），0.28μL特异性扩增引物混合物（100μmo L/L）,0.72μL dd H2O。从可靠性和稳定性可以看出，优化的反应体系可将48份杧果种质资源显著分型。该反应体系的建立可在遗传多样性分析、指纹图谱构建、分子标记辅助育种等多领域对杧果展开研究。

分类号： S667.7

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