茄子全基因组SNP标记的开发
文献类型: 中文期刊
第一作者: 肖熙鸥
作者: 肖熙鸥;聂珩;林文秋;吴彩玉
作者机构:
关键词: 茄子;SNP标记;遗传多样性分析;指纹图谱
期刊名称: 园艺学报
ISSN: 0513-353X
年卷期: 2025 年 52 卷 001 期
页码: 88-100
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 茄子(Solanum melongena L.)是中国重要的茄科蔬菜之一,其具有十分丰富的遗传多样性,对茄子种质资源进行精准评价是利用茄子种质资源的基础。利用40份茄子(Solanum melongena L.)种质资源的重测序数据,筛选了268个SNP位点用于五引物扩增受阻突变体系(penta-primer amplification refractory mutation system,PARMS)-SNP标记的开发,成功获得原创性的120个PARMS-SNP标记。利用这些标记对224份茄子高代自交系进行基因分型,并进一步进行群体结构、PCA主成分分析和遗传树分析。结果表明该224份材料可以分为两个组。同时根据多态性信息含量(polymorphic information content,PIC)值筛选了48个核心PARMS-SNP标记,并且构建了能够将224份材料进行区分的指纹图谱。
分类号: S641.1
- 相关文献
[1]SNP分子标记及其在木本植物遗传育种的应用. 周琳,段玉,文博,马媛春,朱旭君,王玉花,房婉萍. 2018
[2]SNP标记在小麦遗传育种中的应用研究进展. 许陶瑜,唐朝晖,王长彪,任永康,赵兴华,刘江,赵霞. 2017
[3]湖北省水稻区试两系不育系指纹图谱构建及遗传相似性分析. 蔡海亚,谢红卫,周雷,焦春海,游艾青. 2016
[4]基于InDel标记的国内绿豆品种遗传多样性分析及指纹图谱构建. 李群三,陈景斌,顾和平,袁星星,陈新,崔瑾. 2019
[5]非洲水稻种质资源SSR指纹图谱的构建及遗传多样性分析. 黄瑞,周雷,何卫,李三和,陈志军,刘凯,闸雯俊,杨国才,焦春海,游艾青. 2015
[6]基于KASP标记的葡萄品种鉴定. 王富强,张建,温常龙,樊秀彩,张颖,孙磊,刘崇怀,姜建福. 2021
[7]利用CottonSNP63K芯片构建棉花品种的指纹图谱. 孙正文,孙正文,匡猛,马峙英,王省芬. 2017
[8]甘蓝SNP标记开发及主要品种的DNA指纹图谱构建. 李志远,于海龙,方智远,杨丽梅,刘玉梅,庄木,吕红豪,张扬勇. 2018
[9]水稻种质资源全基因组DNA指纹鉴定方法研究. 马小定,崔迪,韩冰,焦成智,韩龙植. 2023
[10]用于羊草基因分型的SNP分子标记技术研究. 侯莉娟,齐晓,齐冬梅,陈双燕,刘公社. 2016
[11]东南亚茄子种质资源ISSR遗传多样性分析. 李涛,黎振兴,罗少波,李植良,徐小万. 2014
[12]茄子全基因组InDel变异特征及分子标记开发和应用. 尤园园,王帅,方莹莹,齐诚,李淑培,张映,陈钰辉,刘伟,刘富中,舒金帅. 2024
[13]贵州省甘蓝型油菜主推品种的SSR遗传多样性分析(英文). 张敏琴,王仙萍,韩宏仕,李敏,雷绍林. 2014
[14]贵州省甘蓝型油菜主推品种的SSR遗传多样性分析. 张敏琴,王仙萍,韩宏仕,李敏,雷绍林. 2013
[15]基于SSR标记的六倍体小黑麦遗传多样性分析. 胡立芹,张超,徐林涛,张一铎,马莹雪,王洪刚. 2015
[16]冬枣×宁梨巨枣的子代SRAP鉴定及遗传多样性分析. 张明慧,宋玉霞,赵世华,丁婕,张国庆,张勤,刘廷俊. 2014
[17]马铃薯种质资源遗传多样性分析及杂交子代SRAP鉴定. 程永芳,张明慧,巩檑,杨琴,宋玉霞. 2015
[18]基于SSR标记的芍药种质资源遗传多样性研究. 李珂楠,杨成龙,范竟超. 2020
[19]40份糜子品种的表型性状鉴定与遗传多样性分析. 景小兰,李志华,董旭,李海. 2018
[20]洋葱种质资源遗传多样性的SRAP和ISSR分析. 刘湘萍,杜敏霞,赵彦,王葆生,刘燕,廉勇,狄洁增,徐卫忠. 2021
作者其他论文 更多>>
-
乙烯利对5个菠萝品种成花及品质的影响
作者:普跃;林文秋;刘朝阳;刘胜辉;吴青松;孙伟生;陆新华;高玉尧;贺军军
关键词:菠萝;乙烯利;成花;抽蕾期;品质
-
菠萝新品种'金筒菠萝'
作者:何业华;刘朝阳;栾爱萍;龚雪;刘佳柔;张伟;林顺权;胡桂兵;刘成明;夏靖娴;林文秋;陈程杰;谢桃;马均;何坚驰;陈少华
关键词:菠萝;品种
-
利用酵母双杂交筛选菠萝AcSWEET11的互作蛋白
作者:林文秋;刘胜辉;张秀梅;张红娜;李运合;吴青松
关键词:菠萝;AcSWEET11;酵母双杂交;互作蛋白
-
不同茄子对瓜蓟马的抗性研究
作者:郭一博;陈悠扬;郭思乐;杜威;杨炳南;林境睿;杨荣超;吴正伟;肖熙鸥
关键词:茄子;瓜蓟马;抗虫性;代谢产物
-
菠萝PARMS反应体系的建立
作者:高云飞;林文秋;吴青松;张秀梅;孙伟生;刘胜辉;姚艳丽
关键词:菠萝;SNP;PARMS;反应体系
-
杧果PARMS反应体系的建立与优化
作者:刘静萍;肖熙鸥;周开兵;柳凤;张国辉;普金安;张翠英;沐云松
关键词:杧果(Mangifera indica L.);SNP;PARMS;体系建立
-
CRISPR/Cas9基因编辑技术在果树作物中的应用研究进展
作者:何玉坤;欧阳嫣惟;张秀梅;林文秋;潘晓璐;张红娜
关键词:果树;CRISPR/Cas9;基因编辑