茄子全基因组SNP标记的开发

文献类型: 中文期刊

第一作者: 肖熙鸥

作者: 肖熙鸥;聂珩;林文秋;吴彩玉

作者机构:

关键词: 茄子;SNP标记;遗传多样性分析;指纹图谱

期刊名称: 园艺学报

ISSN: 0513-353X

年卷期: 2025 年 52 卷 001 期

页码: 88-100

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 茄子(Solanum melongena L.)是中国重要的茄科蔬菜之一,其具有十分丰富的遗传多样性,对茄子种质资源进行精准评价是利用茄子种质资源的基础。利用40份茄子(Solanum melongena L.)种质资源的重测序数据,筛选了268个SNP位点用于五引物扩增受阻突变体系(penta-primer amplification refractory mutation system,PARMS)-SNP标记的开发,成功获得原创性的120个PARMS-SNP标记。利用这些标记对224份茄子高代自交系进行基因分型,并进一步进行群体结构、PCA主成分分析和遗传树分析。结果表明该224份材料可以分为两个组。同时根据多态性信息含量(polymorphic information content,PIC)值筛选了48个核心PARMS-SNP标记,并且构建了能够将224份材料进行区分的指纹图谱。

分类号: S641.1

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