番茄枯萎病菌和颈腐根腐病菌KASP-SNP检测技术的建立

文献类型： 中文期刊

第一作者： 叶青静

作者： 叶青静;王荣青;阮美颖;程远;万红建;李志邈;周国治;姚祝平

作者机构：

关键词： 番茄;尖孢镰刀菌;KASP-SNP标记;分子鉴定;生理小种

期刊名称： 植物保护学报

ISSN： 0577-7518

年卷期： 2022 年 49 卷 003 期

页码： 879-889

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为快速、准确地对番茄枯萎病菌Fusarium oxysporum f.sp.lycopersici(FOL)和番茄颈腐根腐病菌F.oxysporum f.sp.radicis-lycopersici(FORL)进行检测,基于尖孢镰刀菌F.oxysporum多聚半乳糖醛酸外切酶基因pgx4的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点,设计FORL、FOL生理小种1(FOL-R1)、2(FOL-R2)和3(FOL-R3)的竞争性等位基因特异性PCR-SNP(kompetitive allele specific PCR-SNP,KASP-SNP)引物,建立番茄颈腐根腐病菌和番茄枯萎病菌KASP-SNP检测技术,并通过与常规PCR比对及ITS与pgx4序列分析对该检测技术的可靠性进行验证.结果显示,在FORL、FOL-R1、FOL-R2和FOL-R3中存在35个变异SNP位点,设计出18对KASP-SNP 引物,筛 选出 FORL KASP、FOLrace1_KASP、FOLrace2_KASP 和 FOLrace3_KASP 共4对分型清晰的引物.KASP-SNP技术对FORL、FOL-R1和FOL-R2的检测阳性率达100.00%,对FOL-R3的检测阳性率为92.68%;常规PCR方法对FOL-R1和FOL-R3的检测阳性率也达100.00%,而对FORL的检测阳性率只有59.09%.表明所建立的KASP-SNP技术可用于FOL-R1、FOL-R2、FOL-R3和FORL的快速、准确检测.

分类号： S436.412.1

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