大豆NF-YB家族全基因组鉴定、分类和表达

文献类型： 中文期刊

第一作者： 郑炜君

作者： 郑炜君;徐兆师;冯志娟;李连城;陈明;柴守诚;马有志

作者机构：

关键词： NF-YB家族;全基因组鉴定;进化;差异表达;启动子

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2012 年 38 卷 09 期

页码： 1570-1582

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用大豆基因组数据库,通过生物信息学手段,鉴定大豆NF-YB家族基因的全序列、定位和拷贝数,通过序列比对进行进化和分类分析。利用大豆高通量RNA测序数据、NCBI中UniGene的EST表达数据进行组织表达谱分析。结果表明,大豆基因组中含有28个NF-YB家族基因,分布于大豆的14条染色体上,系统进化树分析将其分成3类。启动子分析表明,几乎全部NF-YB家族基因的启动子区均含有逆境应答反应顺式作用元件。各个发育阶段中,多数成员至少在一个组织中表达,10个差异表达的基因中有2个在根瘤中特异表达,2个在根中特异表达,2个在根瘤中优势表达,另外4个在其他部位优势表达。研究结果促进了NF-YB家族基因的功能研究与利用。

分类号： S565.1

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