一株G6P[5]型牛轮状病毒的分离鉴定与全基因组序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 曹存

作者： 曹存;于德斌;徐晓静;于力;常继涛

作者机构：

关键词： 牛轮状病毒;基因序列分析;重配株;分离鉴定

期刊名称： 中国预防兽医学报

ISSN：

年卷期： 2021 年 009 期

页码： 939-945

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了对患腹泻疾病的犊牛进行病原学鉴定,并进一步丰富我国牛轮状病毒（BRV）的流行病学数据,本研究采用RT-PCR方法对8份腹泻犊牛的粪便样品进行BRV VP7基因检测,结果显示有1份样品为阳性。将该阳性病料样品接种Marc-145细胞。对产生细胞病变（CPE）的阳性样品连续传5代后,经间接免疫荧光试验（IFA）和电镜观察,结果表明从粪便样品中分离的病毒为BRV,命名为DZ株。对DZ株的11个基因节段进行RTPCR扩增、测序、拼接后对11个基因节段进行同源性及分型分析;构建分离病毒VP7、VP4基因进化树,分析其遗传进化关系及其氨基酸序列的变异情况。结果显示,DZ株基因组10个基因节段分别与来源于牛（VP2、VP7、NSP1、NSP3）、犬（VP3、NSP5）、羔羊（NSP2）、马（VP6）、猕猴（VP1）、人（NSP4）以及人-牛基因重配（VP4）的轮状病毒株。其中VP1基因与猕猴轮状病毒（RRV）的同源性最高,为81.3%,但低于VP1基因分型的临界值83%,因此DZ株的VP1为新出现的基因型,命名为R17;分离株NSP3基因与法国RF株NSP3基因的同源性高达98%,DZ株与RF株的NSP3属于同一基因型,命名为T18型。所以,本研究分离的BRV DZ株的基因型为G6-P5-I2-R17-C2-M2-A3-N2-T18-E2-H5。VP7和VP4基因遗传进化分析结果显示,DZ株VP7基因来源于韩国KJ69-1株,VP4基因来源于美国疫苗株RotaTeq-SC2-9。与同源性最高的病毒株相比,DZ株VP4、VP7蛋白氨基酸序列分别发生了9处和8处突变。这些突变可能会引起VP7和VP4蛋白的抗原性和组织嗜性变化,进而影响病毒的免疫原性、宿主嗜性以及致病性。综上所述,DZ株是多宿主来源的基因重配病毒株,且主要抗原蛋白VP7和VP4发生了较大变异。本研究为我国BRV遗传进化及其分子流行病学和疫苗的研究奠定了实验基础。

分类号： S852.65

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