甘蓝型油菜BnPPR636及其启动子的克隆与表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 彭鹏飞

作者： 彭鹏飞;胡琼;李云昌;刘道敏;付丽;张洪;梅德圣

作者机构：

关键词： 油菜;同源克隆;PPR基因;CODEHOP;RACE;染色体步移

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2012 年 10 卷 06 期

页码： 74-81

收录情况： CSCD

摘要： PPR蛋白对植物的生长发育、逆境抗性以及育性具有重要的调节作用。本研究根据氨基酸序列的保守性,利用CODEHOP方法,通过简并引物扩增甘蓝型油菜基因组DNA,得到PPR基因片段。结合RACE技术,在甘蓝型油菜品系120中扩增得到了PPR基因cDNA的全长序列。分析发现该PPR基因编码一个含636个氨基酸的蛋白质,具有11个PPR基序,不含有内含子,具有典型的PPR基因特征,命名为BnPPR636。Blast比对发现,BnPPR636与白菜P2克隆的一个未知蛋白的氨基酸序列一致性最高,达到75%。RT-PCR分析表明,BnPPR636在花中的表达量最高,在根与角果中的表达量次之,叶和茎中较低。进化树分析表明,BnPPR636蛋白与其他植物中和CMS育性恢复有关的PPR蛋白序列的一致性较高。以基因组DNA为模板,利用染色体步移技术,得到了BnPPR636基因起始密码子上游1145bp的DNA片段。经生物信息学软件分析表明,该序列具有典型的启动子序列特征,并含有许多相关的顺式作用元件,可能参与调节花和根的发育。

分类号： S565.4

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