高糖土壤微生物宏基因组文库的构建及β-葡萄糖苷酶基因鉴定

文献类型： 中文期刊

第一作者： 陆坚

作者： 杜丽琴;庞浩;马贵;韦宇拓;黄日波

作者机构：

关键词： 高糖土壤;未培养微生物;宏基因组文库;β-葡萄糖苷酶

期刊名称： 基因组学与应用生物学

ISSN： 1674-568X

年卷期： 2013 年 32 卷 01 期

页码： 38-43

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用宏基因组技术构建了高糖土壤微生物的DNA文库,该文库约含9万个克隆,文库外源DNA总容量为3.1×10~9bp。利用活性筛选策略,对文库进行筛选,获得11个β-葡萄糖苷酶的阳性克隆,并对其中2个表达β-葡萄糖苷酶的克隆进行亚克隆和序列分析,获得两个编码新型β-葡萄糖苷酶的基因分别命名为:unbgl3A和unbgl3B。生物信息学分析表明:unbgl3A基因由2241个碱基对组成,unbgl3B基因由2292个碱基对组成。在核苷酸水平上,unbgl3A、unbgl3B与已知数据库中的β-葡萄糖苷酶基因没有任何相似性。在氨基酸水平上,与GenBank数据库中已知β-葡萄糖苷酶的相似性分别为73%和69%。

分类号： S154.3

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