6株A型口蹄疫病毒结构蛋白VP1(1D)基因的核苷酸序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘在新

作者： 刘在新;赵启祖;刘卫;周鹏程;朱彩珠;常慧芸;谢庆阁

作者机构：

关键词： A型口蹄疫病毒，病毒结构蛋白VP1（1D），核苷酸序列

期刊名称： 病毒学报

ISSN： 1000-8721

年卷期： 1998 年 01 期

页码：

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 早期收集保藏的６株Ａ型口蹄疫病毒（Ｆｏｏｔ－ａｎｄ－ｍｏｕｔｈｄｉｓｅａｓｅｖｉｒｕｓ，ＦＭＤＶ）（ＡＬ１－ＡＬ６），适应ＢＨＫ２１单层细胞后，提取６株细胞增殖病毒的ＲＮＡ。用一对ＦＭＤＶ通用引物经反转录（ＲＴ）－ＰＣＲ法扩增了约５００ｂｐ的期望的ＤＮＡ片段。克隆目的基因后，采用双脱氧ＤＮＡ链末端终止法测得了６株病毒的ＶＰ１基因２１０－６３９核苷酸序列。分析表明，３株病毒缺失３个核苷酸，从推导的氨基酸序列比较，确定缺失的３个核苷酸正好是一个密码子，位于氨基酸序列的１５２或１５６位。６株病毒的ＶＰ１核苷酸序列的同源率是９１％－９８％，相应氨基酸序列的同源率为９２．６％－９７．５％。结果显示，核苷酸差异的频率高时，相应氨基酸的改变频度亦高。６株病毒ＶＰ１基因的核苷酸序列与已报导的Ａ型ＦＭＤＶＡ２２的同源性较好（８４％）。６株病毒的主要中和抗原位点ＶＰ１１４０－１６０位氨基酸序列差异较小，可能有相近的中和单抗表位和相同的抗原性。Ｇｏｌｄｋｅｙ软件分析表明，６株病毒间的遗传关系密切，在遗传系谱树上邻接。

分类号： S855.3

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