咖啡ISSR与RAPD-PCR反应体系优化

文献类型: 中文期刊

第一作者: 闫林

作者: 闫林;黄丽芳;谭乐和;范睿;王晓阳;陈鹏;董云萍

作者机构:

关键词: 咖啡;ISSR;RAPD;均匀设计;体系优化

期刊名称: 热带作物学报

ISSN: 1000-2561

年卷期: 2012 年 33 卷 05 期

页码: 79-84

收录情况: CSCD

摘要: 以中粒种咖啡部分种质为试材,采用U25(55)均匀设计表,对影响ISSR和RAPD标记的模板DNA、Mg2+、dNTPs、TaqDNA聚合酶和引物浓度5个因素进行优化,分别建立适合于中粒种咖啡ISSR-PCR和RAPD-PCR标记的反应体系。结果表明:2种标记的反应体系相似,20μL的反应体系中含DNA模板20 ng,Mg2+1.5 mmol/L,dNTPs 0.3 mmol/L,Taq酶1.25 U,引物0.6μmol/L。利用所确立的体系对13份中粒种咖啡种质进行扩增,结果条带清晰明亮,多态性好。

分类号: S571.2

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