基于SNP遗传图谱定位甘蓝型油菜分枝角度QTL

文献类型： 中文期刊

第一作者： 汪文祥

作者： 汪文祥;储文;梅德圣;成洪涛;朱琳琳;付丽;胡琼;刘佳

作者机构：

关键词： 甘蓝型油菜;分枝角度;60K SNP芯片;QTL位点;候选基因

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2019 年 01 期

页码： 37-45

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 分枝角度是油菜株型的重要性状,与油菜的耐密植性密切相关。本研究利用油菜分枝角差异显著的育种亲本材料1098B (分枝角小)和R~2 (分枝角大)杂交获得F1,通过小孢子培养获得含163份株系的DH群体。以油菜60K SNP芯片进行DH群体基因分型,构建高密度遗传图谱,并利用QTL Cartographer 2.5对2个环境下油菜顶端分枝角和基部分枝角进行QTL分析。结果表明,构建的高密度遗传图谱覆盖甘蓝型油菜19条染色体,包含9521个多态性SNP标记, 1442个簇(bin),覆盖基因组长度为2544.07 cM,相邻簇(bin)之间平均距离为1.76 cM。在此图谱基础上采用复合区间作图法(CIM),在2个环境下检测到17个分枝角度QTL,分别位于A01、A02、A03、A06、A09、C02、C03、C04、C06和C08染色体上,单个QTL解释的表型变异为6.39%～21.78%。用比较基因组方法与拟南芥分枝角度同源基因区间比对,鉴定出其中6个QTL的12个候选基因。其中位于A03连锁群QTL在2年的试验中被重复检测到,根据物理位置和基因组信息推测VAMP714为分枝角度的候选基因。这些QTL和候选基因将为油菜分枝角度的遗传改良提供有用的信息。

分类号： S565.4

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