新抗菌肽设计及活性与功能预测

文献类型： 中文期刊

第一作者： 杨丽敏

作者： 杨丽敏;黄燕;张日俊

作者机构：

关键词： α-螺旋;活性因子;活性预测;功能预测;抗菌肽;3D结构

期刊名称： 计算机与现代化

ISSN： 1006-2475

年卷期： 2013 年 02 期

页码： 138-142

摘要： 通过对影响抗菌肽活性因子的分析,确定可量化的因子参数,并对已有抗菌肽的活性因子数据进行统计分析,得到参数取值范围。采用Java技术,对已有抗菌肽序列进行剪切拼接,得到新肽。根据参数取值范围判断新肽,是否有活性,并进行功能预测,同时对抗菌肽构建三维空间结构图。分析证明,亲水端正电荷量是四类抗菌肽具有抗菌活性的重要共性;疏水氨基酸残基百分比和α-螺旋百分比两因子对区分四类抗菌肽功能效果显著。

分类号： Q516

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