不同产地瓠瓜品种ITS序列的遗传多样性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 赵芹

作者： 赵芹;谢大森;彭庆务;罗少波;郭巨先;邓沙沙

作者机构：

关键词： 瓠瓜;ITS序列;变异位点;同源性;遗传分化;系统发育

期刊名称： 植物资源与环境学报

ISSN： 1674-7895

年卷期： 2014 年 03 期

页码： 24-35

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 对国产29个瓠瓜〔Lagenaria siceraria(Molina)Standl.〕品种的ITS序列进行了扩增及测序,并结合引自GenBank的国产9个瓠瓜品种以及国外6个瓠瓜品种和3个同属种类的ITS序列,对它们的ITS序列长度和GC含量以及变异位点进行比较,在此基础上构建系统发育树并对47个样本间的遗传关系进行研究。结果显示:供试47个样本的ITS序列均由ITS1、5.8S rDNA及ITS2组成,各样本间的ITS序列长度、GC含量以及变异位点差异明显。国产38个瓠瓜品种的ITS序列(包括ITS1、5.8S rDNA及ITS2)长度为619~627 bp、GC含量为58.00%~63.32%;国外9个样本的ITS序列长度为591~626 bp,GC含量为54.17%~63.26%。序列比对结果显示:国产38个瓠瓜品种的ITS序列同源率为84.6%~100.0%,包含221个变异位点;其中,来源于山东的品种‘砧木2’(‘Zhenmu No.2’)的ITS序列包含的变异位点最多,与其他品种间的同源率也最低。在系统发育树上,国产38个瓠瓜品种可分为3个分支,来源于山东的品种‘砧木2’和来源于河南的品种‘西瓜砧木1’(‘Xiguazhenmu No.1’)各自聚为第1和第2分支;其余36个品种聚为第3分支。而供试的47个样本则可分为2个分支和5个亚组,第1分支可分为2个亚组,包括国产品种‘砧木2’和产自日本的2个品种;第2分支包含的44个样本则进一步分为3个亚组,国产品种‘西瓜砧木1’和产自法国的品种‘白花瓠瓜’(‘White-flowered gourd’)各自聚为第1和第2亚组,其余的42个样本聚为第3亚组。研究结果表明:供试的不同产地瓠瓜品种间存在丰富的遗传变异和地理分化现象,其ITS序列差异与地理分布有一定关系。

分类号： S642.9

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