长雄野生稻(Oryza longistaminata)全基因组Fosmid文库构建

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李丽娟

作者： 李丽娟;蔡晶;张石来;王荔;胡凤益

作者机构：

关键词： 长雄野生稻;Fosmid文库;末端测序

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2012 年 10 卷 04 期

页码： 86-90

收录情况： CSCD

摘要： 长雄野生稻(O.longistaminata)起源于非洲,具有和亚洲栽培稻相同的AA基因组,是栽培稻改良的重要遗传资源。本研究构建了长雄野生稻全基因组fosmid文库,共获得33.6万克隆,文库的平均插入片段大小约为40kb,其中94.7%的克隆插入片段大小在30~50kb之间。挑取其中约11万克隆并保存,可覆盖10倍栽培稻基因组,对任意基因或序列的筛选概率达到了99.99%。将剩余的22万个克隆进行了末端配对测序,显示其有助于长雄野生稻全基因组测序的拼接。所构建的fosmid文库为筛选和克隆长雄野生稻的有利基因提供了研究材料。

分类号： S511.9

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