贵州省猪戊型肝炎的分子流行病学调查

文献类型： 中文期刊

第一作者： 任荣清

作者： 任荣清;张登祥;徐景峨;杨茂生;王祥兴

作者机构：

关键词： 猪;戊型肝炎病毒;基因型;反转录巢式聚合酶链反应;流行病学调查

期刊名称： 中国兽医科学

ISSN： 1673-4696

年卷期： 2011 年 09 期

页码： 960-967

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采集贵州省戊型肝炎病毒(hepatitis E virus,HEV)抗体阳性的6个猪场新鲜猪粪便样品216份,提取RNA,通过RT-nPCR扩增HEV ORF2基因,对阳性PCR产物进行克隆和测序,采用MEGA5.05软件进行序列比对,构建系统发生树,并经流行病学分析,调查了贵州省猪群的HEV感染情况及基因型。结果显示,HEV主要感染1月龄以上的未成年猪群;粪样采集的6个猪场均不同程度(5.88%～56.52%)地检出HEV RNA阳性,总体阳性率为22.69%(49/216),场群阳性率为100%(6/6);不同类型猪场(养殖户型和养殖场型)HEV RNA阳性率(分别为41.10%和13.29%)差异具有统计学意义(P<0.01),养殖户之间及养殖场之间的阳性率差异无统计学意义(P>0.05),但随着饲养时间的延长,这2种类型猪场的粪便HEV RNA检出率呈上升趋势;测序36个PCR阳性分离株(占73.5%),序列一致性为91.1%～100%,与HEV禽型及Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ型的一致性分别为52.4%～55.4%、75.2%～77.9%、73.6%～75.9%、72.7%～79.1%、83.2%～95.6%,系统发生分析显示与Ⅳ型在同一分支上,属于基因Ⅳ型。结果表明,贵州省猪群普遍存在HEVⅣ型感染。

分类号： S858.28

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