水茄泛素结合酶E2基因StUBCc的克隆及黄萎病菌诱导表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘炎霖

作者： 刘炎霖;陈钰辉;刘富中;张映;连勇

作者机构：

关键词： 水茄;St UBCc;基因克隆;表达分析

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2015 年 42 卷 06 期

页码： 1185-1194

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以茄子近缘野生种水茄(Solanum torvum Swartz)幼苗根部为试材,并以黄萎病菌(大丽轮枝菌,Verticillium dahliae Kleb)处理的水茄的抑制差减文库中差异表达的EST片段F290为基础,利用RACE技术,获得一个756 bp的c DNA全长序列。经生物信息学分析发现该序列为泛素结合酶E2-2(UBC2)载体蛋白同源基因,命名为St UBCc,Gen Bank登录号为KP330492。St UBCc基因编码区共459 bp,编码152个氨基酸,该蛋白分子量为63.0925 k D,等电点为5.13。采用MEGA 5软件对St UBCc和其他同源蛋白的氨基酸序列比对,结果表明其与葡萄的同源蛋白一致性最高,达99%,有很高的功能区段保守性。采用荧光定量PCR对黄萎病菌侵染不同时间的水茄幼苗根部St UBCc基因的表达量进行测定,发现在侵染6 h后,表达量最高,为对照(无菌水处理)的6.79倍。

分类号： S436.411

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