茄子全基因组InDel变异特征及分子标记开发和应用

文献类型： 中文期刊

第一作者： 尤园园

作者： 尤园园;王帅;方莹莹;齐诚;李淑培;张映;陈钰辉;刘伟;刘富中;舒金帅

作者机构：

关键词： 茄子;InDel标记;遗传多样性;指纹图谱;F1代真实性鉴定

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2024 年 51 卷 003 期

页码： 520-532

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 选取4份圆茄(Solanum melongena L.)高代自交系进行全基因组重测序,鉴定出145 407个InDel,12号染色体InDel数最少(7 752),1号最多(19 738).筛选出7 959个长度大于10 bp的InDel位点,挑选均匀分布在基因组上的144个设计InDel引物并进行验证.利用26份茄子材料对144对InDel引物进行筛选,63对表现出稳定的多态性,比例为43.75%;主要等位基因频率为0.4038~0.9808,平均为0.7659;基因多样性指数(Hs)为0.0377~0.6501,平均为0.3217;多态性信息含量(PIC)为0.0370~0.5750,平均为0.2663,42个标记多态性信息含量大于0.200,多态性较好.当遗传距离为0.235时,将26份不同类型的茄子材料划分为2个类群.利用多态性信息含量高的前10个InDel标记构建了 26份茄子材料DNA指纹图谱.另外,选择在亲本间具有多态性的InDel标记用于4个杂交组合的F1代真实性鉴定,鉴定结果表明3个为真实杂交种,与田间鉴定结果吻合.

分类号： S641.1

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