樱桃谷鸭OASL基因全长cDNA的克隆及其生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 毕可然

作者： 毕可然;韩凯凯;李银;刘青涛;赵冬敏;刘宇卓;黄欣梅;杨婧

作者机构：

关键词： 樱桃谷鸭;OASL基因;RACE;生物信息学分析

期刊名称： 江苏农业学报

ISSN： 1000-4440

年卷期： 2017 年 02 期

页码： 373-378

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了获得樱桃谷鸭寡腺苷酸合成酶样蛋白质基因(OASL)全长cDNA,并且初步了解其生物学特性,采用RT-PCR和RACE方法从鸭脾脏组织总RNA中扩增OASL基因cDNA片段,应用生物信息学方法,系统分析鸭OASL的遗传进化以及蛋白质的理化性质、二级结构和亚细胞定位。结果表明,樱桃谷鸭OASL基因(Gen Bank登录号:KX255654)全长1 630 bp,其中包含19 bp的5'UTR(Untranslated region,UTR)、99 bp的3'UTR(Untranslated region,UTR)和PolyA尾巴、1 512 bp的编码区(Coding region,CDS),翻译编码504个氨基酸多肽。鸭OASL蛋白具有寡腺苷酸合成酶(OAS)蛋白家族的典型特征,即N端为寡腺苷酸合成酶样结构域(OAS-like domain,OLD),C端为2个串联的泛素化样结构域(Ubiquitin-like domains,Ub LDs),不具有信号肽和跨膜区。序列比对和系统进化分析结果表明,OASL氨基酸序列在同种之间比较保守,与已报道的鸭OASL的同源性高达100%,与鹅同源性为78%,与人、鼠和猪等哺乳动物的同源性仅为43%~45%。

分类号： S858.32

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