稻瘟菌基因组规模分泌蛋白的预测分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 苏源

作者： 苏源;李成云;赵之伟;周晓罡;李进斌;杨静;刘林;业艳芬

作者机构：

关键词： 稻瘟菌;基因组;信号肽;分泌蛋白

期刊名称： 云南农业大学学报

ISSN： 1004-390X

年卷期： 2006 年 21 卷 03 期

页码： 271-275+292

收录情况： CSCD

摘要： 利用信号肽分析软件S ignalP v3.0,亚细胞器蛋白定位软件TargetP v1.01,GPI-锚定位点软件b ig-PIPred ictor和跨膜螺旋结构软件THMM-2.0这4个软件分析预测稻瘟菌12 595个蛋白序列中有1 134个分泌蛋白。编码这些蛋白的可读框(ORF)最小值为78 bp,最大值为7 849 bp,平均1 231 bp。引导它们的信号肽长度介于15~45个氨基酸之间,平均为21个氨基酸。435个分泌蛋白具有功能描述,主要是与代谢有关的酶类。分析了其中降解细胞壁组分和与致病相关的酶类,提示在稻瘟菌侵染水稻不同阶段产生的关键酶及基因的功能需进一步研究。

分类号： S435.11

  • 相关文献

[1]稻瘟菌效应蛋白研究进展. 郑月琴,林艳,何燕华,陈松彪,王锋. 2013

[2]第二代测序技术用于水稻和稻瘟菌互作早期转录组的分析. 柏斌,吴俊,邓启云,周波. 2012

[3]一种新型稻瘟菌蛋白激发子的克隆与功能研究. 曾洪梅,邱德文. 2011

[4]酿酒酵母分泌蛋白组的计算机分析. 杨静,李成云,王云月,朱有勇,李进斌,何霞红,刘林,业艳芬,周晓罡,唐萍. 2005

[5]大丽轮枝菌(VerticilliumdahliaeVdLs.17)分泌组预测及分析. 田李,陈捷胤,陈相永,汪佳妮,戴小枫. 2011

[6]可可毛色二孢全基因组分泌蛋白的预测及分析. 邢启凯,李铃仙,曹阳,张玮,彭军波,燕继晔,李兴红. 2020

[7]马铃薯晚疫病菌全基因组分泌蛋白的初步分析. 周晓罡,侯思名,陈铎文,陶南,丁玉梅,孙茂林,张绍松. 2011

[8]大丽轮枝菌(Verticillium dahliae VdLs.17)分泌组预测及分析. 田李,陈捷胤,陈相永,汪佳妮,戴小枫. 2011

[9]全基因组预测糙皮侧耳经典胞外分泌蛋白. 谢纯良,龚文兵,严理,朱作华,胡镇修,彭源德. 2017

[10]粗糙脉孢菌基因组分泌蛋白的初步分析. 周晓罡,李成云,赵之伟,苏源,张绍松,李进斌,杨静,刘林,业艳芬. 2006

[11]我国稻瘟病菌的遗传多样性及其地理分布. 沈瑛,朱培良,袁筱萍,赵新华,Levy M. 1998

[12]福建省稻瘟菌的育性及其交配型. 王宝华,鲁国东,张学博,谢联辉,王宗华,袁筱萍,沈瑛. 2000

[13]水稻稻瘟菌抗性相关蛋白的双向电泳分析. 谢娟,黄明星,卢代华,王胜华,陈放. 2006

[14]稻瘟菌无毒基因簇的RAPD标记及其SCAR转化. 林艳,王宝华,杨婕,雷财林,鲁国东,王宗华. 2006

[15]基于PCR的两步法丝状真菌基因敲除方法. 谢鑫,蒋君梅,王勇,任明见. 2019

[16]稻瘟菌若干T-DNA插入突变体初步分析. 魏艺聪,潘初沂,李宏宇,鲁国东,雷财林,王宗华. 2007

[17]稻瘟菌群体中dsRNA的多样性及稻瘟菌菌株QSP5中病毒对寄主生物学性状影响的研究. 唐利华,谢甲涛,程家森,付艳苹,张丽艳. 2016

[18]土壤宏基因组文库的构建及拮抗稻瘟菌克隆子的筛选. 陈旭玉,周亚奎,余贤美,林春花,郑服丛. 2009

[19]水稻地方品种‘月亮谷’纯系对田间稻瘟病菌的选择. 夏欣,陈平,杨伟,徐返,王云月,李成云,郑凤萍,刘永胜,谢勇. 2018

[20]水稻稻瘟病菌单孢分离技术及常见问题分析. 杨军,薛芳,王海凤,郭涛,金桂秀,王佳,陈峰,张士永. 2017

作者其他论文 更多>>

微信小程序