野生大豆*栽培大豆RIL群体高密度遗传图谱构建及SNP偏分离分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘德泉

作者： 刘德泉;聂波涛;邱红梅;陈亮;陈健;崔正果;姬文秀;王跃强

作者机构：

关键词： 栽培大豆;野生大豆;偏分离;SNP;重组自交系

期刊名称： 大豆科学

ISSN： 1000-9841

年卷期： 2023 年 42 卷 006 期

页码： 641-652

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 通过研究野生大豆与栽培种大豆群体构建过程中产生的偏分离现象,发掘偏分离区间(Segregation Distortion Region,SDR)和候选基因,有助于探究偏分离在大豆中的产生机制.应用地方品种"一千粒"和野生品种"长岭野生豆"配置杂交组合,获得F6代重组自交系(Recombinant Inbred Lines,RIL)株系200株,利用SLAF-seq进行测序分析,构建高密度遗传图谱,获得该群体可靠的4 564个SNP标记.偏分离分析发现,648个标记发生偏分离(P<0.05),占总标记的14.20%.获得22个SDR,分布在9个不同的染色体上.在SDR区间内共发现8个重度偏分离热点区域(Extreme Segregation Distortion,ESDR),分布在5个不同的染色体上,其中3个ESDR偏向父本野生型,5个ESDR偏向母本栽培型.利用基因功能注释及全基因组重测序数据,结合ESDR区域,影响胚胎发育(Glyma.01G051400)及雌配子体发育(Glyma.16G072700)的基因分别被认为是ESDR1-1和ESDR16-1的候选基因.本研究结果为今后偏分离基因定位提供可靠依据,并为阐明偏分离现象奠定基础.

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