陆地棉低磷胁迫应答基因GhERF5的克隆与表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 孟超敏

作者： 孟超敏;耿翡翡;卿桂霞;李雪林;张富厚;刘逢举

作者机构：

关键词： 陆地棉;低磷胁迫;基因克隆;表达分析

期刊名称： 西北植物学报

ISSN： 1000-4025

年卷期： 2023 年 003 期

页码： 382-388

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 该研究基于前期陆地棉根部低磷胁迫基因表达谱芯片差异表达序列数据分析及基因组数据库，从陆地棉‘新陆早19’中克隆AP2/ERF基因（GhERF5）,并对其基因组DNA与cDNA测序分析，借助生物信息学方法分析其基因结构和进化关系；采用半定量RT-PCR技术与荧光定量PCR（qRT-PCR）方法检测该基因于根、茎、叶、花等组织的表达变化以及低磷胁迫不同时间的相对表达。结果表明：（1）成功克隆获得一个AP2/ERF基因，命名为GhERF5;GhERF5基因开放阅读框序列长度963 bp,共编码320个氨基酸；该基因在177～241处存在一个AP2保守结构域，属于AP2家族。（2）多序列比对发现，GhERF5与亚洲棉GaERF5、雷蒙德氏GoraiERF5L相似性达到95%;系统进化树分析显示，陆地棉GhERF5蛋白序列与陆地棉GhERF5L（NP＿001386305）的相似性最高，推测GhERF5基因是位于D亚基因组的基因。（3）半定量RT-PCR和qRT-PCR检测发现，GhERF5基因在陆地棉根、茎、叶和花中均有表达，但主要在叶中表达，其次为根和茎，花中的表达量最低；低磷处理0～72 h过程中，GhERF5基因在根部组织中的表达量呈先下降后上升再下降的变化趋势，且在低磷处理72 h时GhERF5的表达量仅为适磷处理的33%。研究表明，GhERF5基因属于低磷胁迫响应基因，可能参与陆地棉低磷胁迫下的应答反应。

分类号： S562

  • 相关文献

[1]陆地棉低磷胁迫应答基因GhGDPD1的克隆与表达分析. 孟超敏,耿翡翡,卿桂霞,张富厚,李雪林,刘逢举. 2023

[2]棉花光籽基因n2的精细定位. 李思敏,宋国立. 2019

[3]陆地棉TLP基因家族的全基因组鉴定及表达分析. 张华崇,张文蔚,简桂良,李蔚. 2019

[4]陆地棉ADH基因家族的全基因组鉴定及表达分析. 李常凤,徐道青,韩文兵,张小娟,齐苗,添长久,郑曙峰. 2018

[5]陆地棉MADS-box家族基因鉴定及组织特异性表达分析. 张爱,张爱,王彩香,宿俊吉,张先亮,史春辉,刘娟娟,彭云玲,马雄风. 2020

[6]陆地棉NF-YA基因家族的全基因组鉴定与功能分析. 潘奥,王静静,孙福来,张景霞,高阳,杜召海,焦梦佳,张军,王芙蓉,刘志. 2020

[7]陆地棉盐胁迫应答基因GhWRKY41的克隆与分析. 苏莹,甄军波,张曦,王玉美,李乐,华金平. 2016

[8]棉花中GhTFL1a和GhTFL1c基因的表达及启动子分析. 张晓红,胡根海,王寒涛,王聪聪,魏恒玲,付远志,喻树迅. 2019

[9]陆地棉Dirigent-like基因(GhDIR)的克隆与分析. 赵付安,房卫平,杨晓杰,谢德意,李武,唐中杰. 2011

[10]一个陆地棉类烯醇酶基因的克隆及其表达分析. 王亦学,孙毅,田颖川,吴家和. 2009

[11]陆地棉盐胁迫应答基因GhPEAMT1的克隆及功能分析. 王娜,王娜,赵资博,高琼,何守朴,马晨辉,彭振,杜雄明. 2021

[12]海岛棉与陆地棉纤维C4H1基因克隆及表达分析. 曹佳强,吕淑萍,李波,杨洋,张经博,谢丽霞,胡文冉,范玲. 2015

[13]棉花3个脂肪酸碳链延长基因的cDNA克隆和表达分析. 刘丽,赵鹏,王丹,刘正杰,王玉美,华金平. 2013

[14]棉花TCP家族转录因子基因GhTCP1的克隆与表达分析. 刘伟娜,韩建民,董金皋,李学勇. 2010

[15]陆地棉转录因子基因GhC2H2的克隆与功能分析. 苏莹,甄军波,张曦,王玉美,华金平. 2016

[16]陆地棉LTP家族基因的克隆与表达分析. 韩慧超,黄逸群,王劲,左开井. 2013

[17]番茄抗黄化曲叶病毒病相关基因ClNLR的功能分析. 李楠,杨玛丽,陈天子,张保龙,赵统敏,杨郁文,刘廷利,余文贵. 2014

[18]丝瓜LcWRKY21转录因子基因的克隆与表达分析. 刘建汀,朱海生,温庆放,王彬,张前荣,陈敏氡,林珲,薛珠政. 2017

[19]耐盐柳树BADH基因克隆及表达分析. 李敏,张健,王奎山,李玉娟,谈峰,王莹. 2013

[20]绵羊血管内皮生长因子D基因克隆与表达分析. 张立春,马惠海,曹阳,孙福亮,翟博. 2016

作者其他论文 更多>>

微信小程序