陆地棉低磷胁迫应答基因GhGDPD1的克隆与表达分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 孟超敏
作者: 孟超敏;耿翡翡;卿桂霞;张富厚;李雪林;刘逢举
作者机构:
关键词: 陆地棉;低磷胁迫;基因克隆;生物信息学分析;表达分析
期刊名称: 浙江农林大学学报
ISSN:
年卷期: 2023 年 004 期
页码: 723-730
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 【目的】基于前期陆地棉‘新陆早19’Gossypium hirsutum‘Xinluzao 19’根部低磷胁迫基因表达谱芯片差异表达序列数据分析,挖掘相关基因,并对其克隆与表达分析。【方法】克隆陆地棉‘新陆早19’GhGDPD1基因并进行基因组DNA与cDNA测序分析,借助生物信息学方法分析GhGDPD1的基因结构和进化关系;采用半定量RT-PCR技术与实时荧光定量PCR (RT-qPCR)的方法检测该基因于根、茎、叶、花等4个组织的基因表达量的变化以及低磷胁迫下的表达模式。【结果】成功克隆GhGDPD1基因,开放阅读框序列长度为1 149 bp,共编码382个氨基酸,属于GDPD家族,其中存在一个保守结构域,名为GDPD_GDE5_like_1_plant。半定量RT-PCR和RT-qPCR试验结果均显示:GhGDPD1基因主要表达于根,中量表达于花和茎,微量表达于叶。该基因在受到低磷胁迫的刺激后,立即会对低磷胁迫做出应答,胁迫4 h相对表达量达到最高值。【结论】首次成功克隆到陆地棉‘新陆早19’GhGDPD1基因,获得了GhGDPD1基因的组织表达以及低磷胁迫下的表达模式,为深入解析棉花GhGDPD1基因的生物学功能以及培育棉花磷高效利用新种质提供科学参考。图7表1参18
分类号: S562
- 相关文献
[1]陆地棉低磷胁迫应答基因GhERF5的克隆与表达分析. 孟超敏,耿翡翡,卿桂霞,李雪林,张富厚,刘逢举. 2023
[2]菊花抗白色锈病相关基因CmDREBa-2的克隆及表达分析. 熊超明,赵兴华,贾红梅,延昕,毛洪玉. 2018
[3]高粱转录因子基因SbSBP15的克隆及表达分析. 方远鹏,蒋君梅,杜巧丽,陈美晴,裴会敏,屈志广,任明见,谢鑫. 2020
[4]高羊茅FaGST1基因克隆、亚细胞定位及表达分析. 陈锡,赵德刚,陈莹,吴佳海,袁暘暘,王小利. 2020
[5]洋葱黄酮醇合成酶基因的克隆与表达分析. 王振宝,杨妍妍,刘冰江,霍雨猛,李艳伟,孙亚玲,吴雄. 2022
[6]木薯MeAFP2-like基因的序列特征及表达分析. 肖亮,尚小红,单忠英,曹升,曾文丹,严华兵. 2018
[7]白三叶TrDFR基因克隆及表达分析. 张婷婷,刘洋,许本波,田宏,熊军波,陆姣云,张鹤山. 2022
[8]海岛棉耐盐相关基因GbPLA1-32的克隆及生物信息学分析. 张红,张悦新,徐楠,芮存,范亚朋,王晶,韩明格,王琴琴,孙亮庆,陈修贵,陆许可,王俊娟,王德龙,王帅,郭丽雪,赵兰杰,陈超,陈全家,叶武威. 2024
[9]滇龙胆乙酰CoA转移酶基因的克隆与表达分析. 张晓东,李彩霞,王连春,王元忠. 2016
[10]芒果核苷二磷酸激酶(NDPK)基因克隆及表达分析. 罗睿雄,赵志常,黄建峰,党志国,高爱平. 2016
[11]欧洲葡萄NF-YB3基因克隆与表达分析. 崔小月,尚泓泉,吕中伟,娄玉穗,张柯,樊红杰,吴文莹,张晓锋. 2024
[12]谷子NCED3基因克隆及生物信息学和表达模式分析. 王艳珂,黎飞飞,陈二影,杨延兵,管延安,高文伟,秦岭. 2022
[13]甘蔗蔗糖转运蛋白SoSUT5基因克隆、表达及功能鉴定. 苗小荣,王道波,杨丽涛,李杨瑞. 2018
[14]棉花DNA甲基转移酶GhDMT9抗逆性分析. 杨笑敏,杨笑敏,芮存,张悦新,王德龙,王俊娟,陆许可,陈修贵,郭丽雪,王帅,陈超,叶武威. 2019
[15]棉花GhUGT75L6的生物信息学分析及功能验证. 王心蕾,王心蕾,陆许可,陈修贵,王俊娟,王德龙,王帅,郭丽雪,陈超,叶武威. 2021
[16]棉花GhDMT3的功能验证及生物信息学分析. 叶武威,叶武威. 2019
[17]陆地棉GhPKE1的生物信息学分析及功能验证. 王琴琴,陈修贵,陆许可,王帅,张悦新,范亚朋,陈全家,叶武威. 2022
[18]陆地棉GhPYR1基因的克隆和功能分析. 刘妍,孟志刚,孙国清,王远,周焘,郭三堆,张锐. 2016
[19]陆地棉GhDHN1基因结构及内含子生物信息学分析. 王俊娟,郭丽雪,陆许可,阴祖军,王德龙,陈修贵,王帅,樊伟丽,陈超,叶武威. 2018
[20]陆地棉膜结合脂肪酸去饱和酶基因家族的全基因组鉴定及表达分析. 陈义珍,李浩,傅明川,王立国,刘任重,柳展基. 2023
作者其他论文 更多>>
-
陆地棉低磷胁迫应答基因GhERF5的克隆与表达分析
作者:孟超敏;耿翡翡;卿桂霞;李雪林;张富厚;刘逢举
关键词:陆地棉;低磷胁迫;基因克隆;表达分析
-
微波炉烘干棉花叶片用于DNA提取的效果分析
作者:付小琼;付小琼;李超;刘逢举;刘媛;彭军
关键词:微波炉烘干;DNA;棉花;叶片
-
不同基因型棉花苗期耐磷性评价及鉴定指标筛选
作者:孟超敏;孟超敏
关键词:棉花;苗期;耐磷性;指标
-
低磷胁迫下不同基因型棉花生理和形态的响应差异
作者:孟超敏;孟超敏
关键词:棉花;低磷胁迫;磷利用效率;变异系数
-
利用SSR分子标记构建邯棉559、邯棉802和邯郸885的指纹图谱
作者:付小琼;杨保新;杨付新;刘逢举;刘媛;蔡家滨;彭军
关键词:邯棉559;邯棉802;邯郸885;SSR;指纹图谱;纯度
-
基于DNA-SSR分析2015年度我国主推棉花杂交种纯度
作者:杨付新;彭军;刘逢举;刘媛
关键词:棉花;杂交种;SSR;纯度检测;分子鉴定
-
我国早熟陆地棉品种遗传多样性分析
作者:朱新霞;吕军;刘逢举;杨付新;努斯来提·吾斯曼
关键词:棉花;早熟;SSR标记;遗传多样性