半滑舌鳎trim36基因cDNA克隆及表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王文文

作者： 王文文;朱颖;位战飞;郑卫卫;董忠典;高峰涛;邵长伟;温海深;陈松林

作者机构：

关键词： 半滑舌鳎;三重基序蛋白基因(trim36);克隆;qRT-PCR;原位杂交

期刊名称： 农业生物技术学报

ISSN： 1674-7968

年卷期： 2016 年 24 卷 07 期

页码： 968-979

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 三重基序蛋白(the tripartite motif-containing protein,TRIM)家族是一类结构保守、进化快速的E3泛素蛋白连接酶,参与诸多重要的生命过程。TRIM36是TRIM家族的一员,trim36编码E3泛素蛋白连接酶。本研究在已完成的半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)全基因组测序及转录组测序的基础上,利用RACE技术克隆得到半滑舌鳎trim36基因(Gen Bank登录号:KU244470),序列全长为2 899 bp,其中ORF为2 214 bp,编码737个氨基酸,5'非翻译区(untranslated regions,UTR)为289 bp,3'UTR为396 bp。生物信息学分析显示,半滑舌鳎TRIM36蛋白包含1个锌指结构,2个B-BOX类型锌指蛋白结构域(B-Box-type zinc finger,BBOX),1个卷曲螺旋结构,1个羧基末端的纤连蛋白Ⅲ(fibronectin typeⅢ,FN3)结构域和1个双特异性蛋白激酶spla和兰尼碱受体(spla kinase and ryanodine receptor,SPRY)结构域。此外,在不同脊椎动物中,trim36基因与其邻近的基因具有保守的共线性关系。半定量RT-PCR及q RT-PCR结果显示,在半滑舌鳎不同组织中,trim36基因表达存在差异。trim36在卵巢中表达量最高,其次为雌、雄鱼的脑中;不同发育时期中,trim36基因在120日龄半滑舌鳎性腺中开始表达,且卵巢表达量显著高于精巢(P<0.05)。原位杂交结果显示,trim36基因杂交信号主要出现在Ⅰ期和Ⅱ期卵母细胞。trim36时空表达特征表明,其在卵巢腔的形成及Ⅰ期、Ⅱ期卵母细胞的形成中起重要作用。结果表明,trim36在性别发生方面有一定的作用,这为进一步研究鱼类trim36基因功能及TRIM家族基因功能提供线索和参考。

分类号： S917.4

  • 相关文献

[1]半滑舌鳎StAR基因克隆及其在不同组织的时空表达分析. 朱颖,孟亮,胡乔木,王晓夏,常亚青,陈松林. 2014

[2]甜菜夜蛾感觉神经元膜蛋白SNMP1和SNMP2的克隆和定位. 刘杨,王桂荣. 2012

[3]膜孕激素受体(mPRα)在半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)卵母细胞成熟过程中的表达特征. 李晓妮,柳学周,史宝,徐永江,张金勇. 2017

[4]半滑舌鳎雌、雄鱼myostatin基因差异表达的初步研究. 张梦倩,崔忠凯,陈张帆,徐文腾,陈松林. 2022

[5]半滑舌鳎gata5基因的克隆及表达分析. 董忠典,张宁,崔忠凯,徐文腾,陈松林. 2019

[6]半滑舌鳎促性腺激素α亚基cDNA的克隆及组织表达特征. 李晓晓,柳学周,史宝,徐永江,王珊珊,刘芝亮,王妍妍. 2013

[7]中华鲟piwil1基因的克隆表达特征研究. 李创举,杨晓鸽,岳华梅,叶欢,危起伟. 2016

[8]黄鳝细胞质动力蛋白3基因的克隆及其在性逆转中的功能分析. 连子童,夏雪平,李忠,田海峰,蒋钦杨,胡乔木. 2023

[9]香蕉果实类受体蛋白激酶基因克隆及RNAi载体构建. 张建斌,刘菊华,贾彩红,金志强,徐碧玉. 2013

[10]香蕉类受体蛋白激酶基因的克隆及杂交鉴定(英文). 张建斌,金志强,刘菊华,贾彩红,赵丽丽,徐碧玉. 2012

[11]文心兰FT同源基因的克隆及其表达分析. 林榕燕,方能炎,罗远华,黄敏玲,叶秀仙,钟淮钦. 2019

[12]杂交兰尿卟啉原脱羧酶基因的克隆及其表达分析. 林榕燕,吴建设,林兵,叶秀仙,钟淮钦,黄敏玲. 2020

[13]木薯查尔酮合酶MeCHS基因家族特征与表达分析. 安飞飞,齐剑雄,陈松笔,罗秀芹,蔡杰,薛晶晶. 2023

[14]贵州黑山羊LYRM1基因生物信息学及组织表达分析. 杨洋,陈浩林,徐敏. 2020

[15]秋石斛钙依赖蛋白激酶基因的克隆及表达分析. 林榕燕,钟淮钦,陈艺荃,方能炎,孔兰,叶秀仙. 2022

[16]梨树PyS6PDH2基因的克隆及其在不同树形条件下的表达分析. 刘政,林世华,安莉园,秦仲麒,伍涛,李先明,涂俊凡,杨夫臣,朱红艳,杨立. 2017

[17]半滑舌鳎孕酮受体膜组分1基因的克隆及组织和时空表达规律. 张金勇,柳学周,史宝,徐永江,李晓妮,常亚青,王滨. 2016

[18]半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis Günther)α-淀粉酶基因的克隆及牛磺酸对其表达的影响. 秦帮勇,常青,于朝磊,柳淑芳,马骞,郑珂珂. 2013

[19]半滑舌鳎抗缪勒氏管激素(AMH)基因的克隆及组织表达分析. 刘姗姗,孙冰,梁卓,张静,陈松林. 2013

[20]半滑舌鳎HIRA基因部分cDNA序列克隆及表达分析. 刘姗姗,张静,陈松林. 2013

作者其他论文 更多>>

微信小程序