基于单核苷酸多态性标记的7个斑鳢野生群体的遗传结构和遗传多样性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 崔同心

作者： 崔同心;刘海洋;张晋;欧密;罗青;费树站;陈昆慈;赵建

作者机构：

关键词： 斑鳢;SNP;遗传结构;遗传多样性

期刊名称： 中国水产科学

ISSN： 1005-8737

年卷期： 2024 年 31 卷 007 期

页码： 829-838

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为探讨斑鳢(Channa maculata)自然分布群体的遗传结构和遗传多样性,基于SLAF简化基因组测序技术检测了斑鳢 7 个群体(广东阳春、广东化州、广西南宁、广西贺州、湖南江华、福建邵武、台湾台北)的 SNP 标记,并进行遗传学分析.结果显示,共检测出 2502887 个SNP位点,平均测序深度为 20.19X,平均Q30 和GC含量分别为 95.31%和 41.16%.7 个斑鳢群体多态性信息含量(PIC)为 0.2672~0.2872,期望杂合度(He)为 0.3304~0.3580,观测杂合度(Ho)为 0.2145~0.3393,群体遗传多样性处于中等水平.群体间遗传分化指数(Fst)为 0.15300~0.78658,基因流(Nm)为 0.24118~0.62035,群体间表现出高度遗传分化状态,台北群体与其他 6 个群体间遗传分化程度极大(Fst>0.5).群体遗传结构分析表明,7 个群体均单独聚类,遗传结构单一.本研究揭示了不同地区野生斑鳢群体的遗传背景和亲缘关系,对斑鳢种质资源的合理利用和遗传育种工作具有重要的参考意义.在后续的育种工作中,应特别关注不同斑鳢群体间的亲缘关系,以期提高斑鳢亲本质量和育种效率.

分类号： S917

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