牛肠道病毒北京株的分离鉴定及全基因组分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张姗

作者： 张姗;李晓轩;侯绍华;鑫婷;林湛椰;袁万哲;孙继国

作者机构：

关键词： 牛肠道病毒;分离;基因组;比对分析

期刊名称： 中国兽医科学

ISSN： 1673-4696

年卷期： 2018 年 07 期

页码： 844-850

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用RT-PCR方法从北京某牛场有腹泻症状牛的粪便样品中检测到牛肠道病毒(bovine enterovirus,BEV),分离出1株病毒并将其命名为BJ101。然后,通过电镜观察、全基因组序列测定和同源性分析,对该毒株进行了验证。结果,BJ101分离株在MDBK细胞上的TCID50为1×10-6.42/0.1 m L,电镜观察到病毒颗粒直径为25~30 nm,无囊膜,呈典型的小RNA病毒粒子形态;BJ101株的基因组长度为7 409 bp,其中5′非编码区(UTR)长812 bp,3′UTR长72 bp,病毒基因组开放阅读框(ORF)全长6 525 bp。对全基因组序列进行比对分析显示,在5′UTR区、编码区和3′UTR区,BJ101分离株与BEV E2型毒株的核苷酸相似性最高。基于VP1基因的系统进化树表明,BJ101株是BEV E2型的成员。上述结果丰富了国内牛肠道病毒的基因库,为BEV的诊断及预防奠定了良好的基础。

分类号： S852.65

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